RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 HK3P52790 923 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 NPRL3Q12980 569 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SPHARQ15513 63 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TGFBIQ15582 683 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 AMHR2Q16671 573 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SEZ6Q53EL9 994 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 MANEAQ5SRI9 462 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ACBD7Q8N6N7 88 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 NEIL3Q8TAT5 605 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa4.71□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 FUZQ9BT04 418 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TPT1P8Q9HAU6 139 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SMCO4Q9NRQ5 59 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 CFAP97Q9P2B7 532 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SLC17A7Q9P2U7 560 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 GMEB2Q9UKD1 530 aa4.71□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 M0R036 132 aa4.71□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 PAGE1O75459 146 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TNNI3P19429 210 aa4.71□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 NKX3-2P78367 333 aa4.71□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 SLC35D3Q5M8T2 416 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 LYRM7Q5U5X0 104 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 CPZQ66K79 652 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 CLEC4DQ8WXI8 215 aa4.71□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 JAM3Q9BX67 310 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 CHRDQ9H2X0 955 aa4.71□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 SLC17A5Q9NRA2 495 aa4.71□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 MOKQ9UQ07 419 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa4.71□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 PSME4Q14997 1843 aa4.71□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 GOT1P17174 413 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 F2P00734 622 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 G6PDP11413 515 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 CASRP41180 1078 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TM4SF4P48230 202 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 DOC2AQ14183 400 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 RAB11BQ15907 218 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM69Q5SWH9 247 aa4.7□□□□□ -1.66
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