RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 I3L1I5 382 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
UPP1-201ENST00000331803 DUX1O43812 170 aa18.02■□□□□ 0.48
UPP1-201ENST00000331803 LDB3O75112 727 aa18.02■□□□□ 0.48
UPP1-201ENST00000331803 MED26O95402 600 aa18.02■□□□□ 0.48
UPP1-201ENST00000331803 ALPLP05186 524 aa18.02■□□□□ 0.48
UPP1-201ENST00000331803 PORP16435 677 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
UPP1-201ENST00000331803 RAB38P57729 211 aa18.02■□□□□ 0.48
UPP1-201ENST00000331803 GPLD1P80108 840 aa18.02■□□□□ 0.48
UPP1-201ENST00000331803 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
UPP1-201ENST00000331803 NR1D2Q14995 579 aa18.02■□□□□ 0.48
UPP1-201ENST00000331803 IFI44LQ53G44 452 aa18.02■□□□□ 0.48
UPP1-201ENST00000331803 GATAD2AQ86YP4 633 aa18.02■□□□□ 0.48
UPP1-201ENST00000331803 PLXDC1Q8IUK5 500 aa18.02■□□□□ 0.48
UPP1-201ENST00000331803 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
UPP1-201ENST00000331803 METTL25Q8N6Q8 603 aa18.02■□□□□ 0.48
UPP1-201ENST00000331803 SMYD1Q8NB12 490 aa18.02■□□□□ 0.48
UPP1-201ENST00000331803 MIPOL1Q8TD10 442 aa18.02■□□□□ 0.48
UPP1-201ENST00000331803 C16orf58Q96GQ5 468 aa18.02■□□□□ 0.48
UPP1-201ENST00000331803 YIPF4Q9BSR8 244 aa18.02■□□□□ 0.48
UPP1-201ENST00000331803 ADI1Q9BV57 179 aa18.02■□□□□ 0.48
UPP1-201ENST00000331803 IRAK4Q9NWZ3 460 aa18.02■□□□□ 0.48
UPP1-201ENST00000331803 VNN3Q9NY84 501 aa18.02■□□□□ 0.48
UPP1-201ENST00000331803 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa18.02■□□□□ 0.48
UPP1-201ENST00000331803 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa18.02■□□□□ 0.48
UPP1-201ENST00000331803 PI4KAP42356 2102 aa18.02■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa18.02■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa18.02■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 CHST10O43529 356 aa18.02■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 FOXS1O43638 330 aa18.02■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 SLC28A2O43868 658 aa18.02■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 FGF17O60258 216 aa18.02■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 GPR75O95800 540 aa18.02■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 CHN2P52757 468 aa18.02■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 SKP1P63208 163 aa18.02■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 ID2Q02363 134 aa18.02■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 CFHR1Q03591 330 aa18.02■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 SYPL1Q16563 259 aa18.02■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 TCTE1Q5JU00 501 aa18.02■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 TMEM154Q6P9G4 183 aa18.02■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 CARM1Q86X55 608 aa18.02■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 HIPK1Q86Z02 1210 aa18.02■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 ARMC8Q8IUR7 673 aa18.02■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 OR7G2Q8NG99 324 aa18.02■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 DUSP23Q9BVJ7 150 aa18.02■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD60Q9BZ19 345 aa18.02■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 FSCN3Q9NQT6 498 aa18.02■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 HYKKA2RU49 373 aa18.01■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 HPRP00739 348 aa18.01■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 NR2F1P10589 423 aa18.01■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 TNFRSF1BP20333 461 aa18.01■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 ITGA1P56199 1179 aa18.01■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 FAM53BQ14153 422 aa18.01■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 HLA-BQ31612 363 aa18.01■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 SLC36A3Q495N2 470 aa18.01■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 GARNL3Q5VVW2 1013 aa18.01■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 NIPAL1Q6NVV3 410 aa18.01■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa18.01■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 CARFQ8N187 725 aa18.01■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 TMEM105Q8N8V8 129 aa18.01■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 OSBPL10Q9BXB5 764 aa18.01■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 SMURF2Q9HAU4 748 aa18.01■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 BATF3Q9NR55 127 aa18.01■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 NTMQ9P121 344 aa18.01■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 SCOCQ9UIL1 159 aa18.01■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 SCN2AQ99250 2005 aa18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 TMEM221A6NGB7 291 aa18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 M0R296 226 aa18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 PLOD2O00469 737 aa18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 PDE9AO76083 593 aa18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 SNAP29O95721 258 aa18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 CD1CP29017 333 aa18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 PPP2R1BP30154 601 aa18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 OR1E2P47887 323 aa18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 ARHGDIAP52565 204 aa18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 PPP2R2BQ00005 443 aa18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 DUSP7Q16829 419 aa18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 SAP25Q8TEE9 199 aa18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 GIMAP5Q96F15 307 aa18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 ZNF607Q96SK3 696 aa18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 EQTNQ9NQ60 294 aa18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 NDUFAF4Q9P032 175 aa18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 DPM1O60762 260 aa18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 MFN2O95140 757 aa18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 ATP1B1P05026 303 aa18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 PRKACGP22612 351 aa18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 SEPHS1P49903 392 aa18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 HSD11B2P80365 405 aa18■□□□□ 0.47
UPP1-201ENST00000331803 KCNAB1Q14722 419 aa18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms