RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313843.7

STX4-201, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STX4, Length 1,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-201ENST00000313843 RPS18P62269 152 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 SERTAD2Q14140 314 aa20.51■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 NSDHLQ15738 373 aa20.51■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 CPZQ66K79 652 aa20.51■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 TMEM107Q6UX40 140 aa20.51■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 ZNF621Q6ZSS3 439 aa20.51■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 MSRB3Q8IXL7 192 aa20.51■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 OR5AK3PQ8NH89 298 aa20.51■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 KAT2AQ92830 837 aa20.51■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 FGF11Q92914 225 aa20.51■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 ROPN1LQ96C74 230 aa20.51■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 LRRC58Q96CX6 371 aa20.51■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 MESP1Q9BRJ9 268 aa20.51■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 TRIM8Q9BZR9 551 aa20.51■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 NEUROD4Q9HD90 331 aa20.51■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 WDR70Q9NW82 654 aa20.51■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 GID8Q9NWU2 228 aa20.51■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 VPS4AQ9UN37 437 aa20.51■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 ALOX12BO75342 701 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 ERN1O75460 977 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 C1QCP02747 245 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 DLSTP36957 453 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 STT3AP46977 705 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 NCALDP61601 193 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 DNASE1L3Q13609 305 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 FAM111BQ6SJ93 734 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 HACD2Q6Y1H2 254 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 MAGED4Q96JG8 741 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 CGREF1Q99674 301 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 FAM117AQ9C073 453 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 ANKRA2Q9H9E1 313 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 ACACBO00763 2458 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 A8MUA0 341 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 ATP5HO75947 161 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 UMODP07911 640 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 KRT16P08779 473 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 CT62P0C5K7 136 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 SOX18P35713 384 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 FOLR3P41439 243 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 MC3RP41968 323 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 TGIF1Q15583 401 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 ZNF628Q5EBL2 1059 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 PSMA8Q8TAA3 256 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 GPR87Q9BY21 358 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 TAS2R1Q9NYW7 299 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 MAT2BQ9NZL9 334 aa20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 F8A1P23610 371 aa20.49■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 SZRD1Q7Z422 152 aa20.49■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 ANKRD37Q7Z713 158 aa20.49■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 OR7G2Q8NG99 324 aa20.49■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 OR2Y1Q8NGV0 311 aa20.49■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 DNAJB8Q8NHS0 232 aa20.49■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 SLC35A5Q9BS91 424 aa20.49■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 SEMA3GQ9NS98 782 aa20.49■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 KCND3Q9UK17 655 aa20.49■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 TERTO14746 1132 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 NPPAP01160 153 aa20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 ZCCHC18P0CG32 403 aa20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 PTPN4P29074 926 aa20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 PSME3P61289 254 aa20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 MGAT2Q10469 447 aa20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 BIKQ13323 160 aa20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 SELPLGQ14242 412 aa20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 SPDYE7PQ495Y7 208 aa20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 GALNT12Q8IXK2 581 aa20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 DEFB107AQ8IZN7 70 aa20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 PGAM4Q8N0Y7 254 aa20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 SIMC1Q8NDZ2 872 aa20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 ZNF675Q8TD23 568 aa20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 METTL21AQ8WXB1 218 aa20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 RIT1Q92963 219 aa20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 ELP4Q96EB1 424 aa20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 PHF12Q96QT6 1004 aa20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 CXorf21Q9HAI6 301 aa20.48■□□□□ 0.87
STX4-201ENST00000313843 ADAP2Q9NPF8 381 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms