RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225576.7

TVP23C-201, Transcript of trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TVP23C, Length 1,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23C-201ENST00000225576 SZRD1Q7Z422 152 aa15.78■□□□□ 0.12
TVP23C-201ENST00000225576 EPHX4Q8IUS5 362 aa15.78■□□□□ 0.12
TVP23C-201ENST00000225576 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa15.78■□□□□ 0.12
TVP23C-201ENST00000225576 GALNT4Q8N4A0 578 aa15.78■□□□□ 0.12
TVP23C-201ENST00000225576 EID2Q8N6I1 236 aa15.78■□□□□ 0.12
TVP23C-201ENST00000225576 NUP43Q8NFH3 380 aa15.78■□□□□ 0.12
TVP23C-201ENST00000225576 LOXL4Q96JB6 756 aa15.78■□□□□ 0.12
TVP23C-201ENST00000225576 MAGED4Q96JG8 741 aa15.78■□□□□ 0.12
TVP23C-201ENST00000225576 HSH2DQ96JZ2 352 aa15.78■□□□□ 0.12
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF597Q96LX8 424 aa15.78■□□□□ 0.12
TVP23C-201ENST00000225576 NUDT22Q9BRQ3 303 aa15.78■□□□□ 0.12
TVP23C-201ENST00000225576 OR51I1Q9H343 314 aa15.78■□□□□ 0.12
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
TVP23C-201ENST00000225576 PTGFRNQ9P2B2 879 aa15.78■□□□□ 0.12
TVP23C-201ENST00000225576 OAZ3Q9UMX2 235 aa15.78■□□□□ 0.12
TVP23C-201ENST00000225576 TMEM247A6NEH6 219 aa15.77■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 C5orf58C9J3I9 102 aa15.77■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 UPK1AO00322 258 aa15.77■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 OR2B3O76000 313 aa15.77■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 OR12D1P0DN82 309 aa15.77■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 PTGER1P34995 402 aa15.77■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 PRKAG1P54619 331 aa15.77■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 LTB4RQ15722 352 aa15.77■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 SNAP47Q5SQN1 464 aa15.77■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 PERM1Q5SV97 790 aa15.77■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa15.77■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 LZICQ8WZA0 190 aa15.77■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 RAB8BQ92930 207 aa15.77■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 COL26A1Q96A83 441 aa15.77■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 VPS50Q96JG6 964 aa15.77■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 DPYSL5Q9BPU6 564 aa15.77■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 PDP2Q9P2J9 529 aa15.77■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 P2RX2Q9UBL9 471 aa15.77■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 RAB26Q9ULW5 256 aa15.77■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 SCN3AQ9NY46 2000 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 TMEM150CB9EJG8 249 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 SOCS2O14508 198 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 ASNA1O43681 348 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 LDB3O75112 727 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 RASAL1O95294 804 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 CPNE6O95741 557 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 BCHEP06276 602 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 KCNJ10P78508 379 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 MAPK11Q15759 364 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 NRF1Q16656 503 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 TLDC1Q6P9B6 456 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 VTCN1Q7Z7D3 282 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF595Q8IYB9 648 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 SHISA5Q8N114 240 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 OR2L13Q8N349 312 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 CBR4Q8N4T8 237 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 OR7G2Q8NG99 324 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 OR2I1PQ8NGU4 316 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 XAGE5Q8WWM1 108 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 KAT2AQ92830 837 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 TAMM41Q96BW9 452 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 MVB12AQ96EY5 273 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 TMEM19Q96HH6 336 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 TPD52L3Q96J77 140 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 CUTCQ9NTM9 273 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 TRPC4Q9UBN4 977 aa15.76■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 A0A087WV62 115 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 GNGT2O14610 69 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 DENRO43583 198 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 CTNSO60931 367 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 PDE9AO76083 593 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 BMP10O95393 424 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 PGM3O95394 542 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 FABP3P05413 133 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 RPSAP08865 295 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 ANKRD34CP0C6C1 535 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 SLC35E2P0CK97 266 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 CKMT1AP12532 417 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 FOLR1P15328 257 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 GCGRP47871 477 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 GNA13Q14344 377 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF628Q5EBL2 1059 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 LGI4Q8N135 537 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 OR4D9Q8NGE8 314 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF675Q8TD23 568 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 TMBIM1Q969X1 311 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 GIMAP5Q96F15 307 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 MS4A4EQ96PG1 132 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 ACTRT3Q9BYD9 372 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 LRRN3Q9H3W5 708 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 Q9H521 79 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 HCN3Q9P1Z3 774 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 SERTAD3Q9UJW9 196 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 GMEB2Q9UKD1 530 aa15.75■□□□□ 0.11
TVP23C-201ENST00000225576 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms