RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 CNIH2Q6PI25 160 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 OR6C4Q8NGE1 309 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 RELTQ969Z4 430 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 IL21Q9HBE4 155 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 LRG1P02750 347 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 SCG5P05408 212 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 MSL3P1P0C860 447 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 CHRNB1P11230 501 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 MYL12AP19105 171 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 SAXO2Q658L1 398 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 KRT73Q86Y46 540 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 SFTPA1Q8IWL2 248 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 OR4K5Q8NGD3 323 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 GULP1Q9UBP9 304 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 TRIOO75962 3097 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 IGHA2P01877 340 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 RHCEP18577 417 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 MMP11P24347 488 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 GPR19Q15760 415 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 OXR1Q8N573 874 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 OR52I1Q8NGK6 324 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC7A6Q92536 515 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 C17orf62Q9BQA9 187 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 MED20Q9H944 212 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 STUB1Q9UNE7 303 aa16.45■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 HELZP42694 1942 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 PLA2G10O15496 165 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 FCER2P06734 321 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 OSMP13725 252 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 GPR4P46093 362 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 CEP78Q5JTW2 689 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM26DQ5JW98 314 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 SYT9Q86SS6 491 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 BBS1Q8NFJ9 593 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 BEST4Q8NFU0 473 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 OR6T1Q8NGN1 323 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 GLYATL1Q969I3 302 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 VOPP1Q96AW1 172 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 C16orf58Q96GQ5 468 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC22A4Q9H015 551 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 MAT2BQ9NZL9 334 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 CLCA2Q9UQC9 943 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 H0YIV9 168 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 H3BSH0 61 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 IL12RB1P42701 662 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 FABP5Q01469 135 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 PGBD2Q6P3X8 592 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 GPR155Q7Z3F1 870 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 ZER1Q7Z7L7 766 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 MARCH9Q86YJ5 346 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 LAS2Q8IYD9 372 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 RNFT2Q96EX2 444 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 KLHL1Q9NR64 748 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 TDP1Q9NUW8 608 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 FKBP14Q9NWM8 211 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 ALG5Q9Y673 324 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 KCNE3Q9Y6H6 103 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 MAU2Q9Y6X3 613 aa16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 C1orf105O95561 183 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 TIMP2P16035 220 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 UQCRC1P31930 480 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 WASP42768 502 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 TAP2Q03519 686 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 WSCD2Q2TBF2 565 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 IDNKQ5T6J7 187 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 DDI2Q5TDH0 399 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 CCDC116Q8IYX3 515 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 FBXW2Q9UKT8 454 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 CORO2BQ9UQ03 480 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 A0A0X1KG70 313 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 OR1F1O43749 312 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 POP7O75817 140 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 KLHL18O94889 574 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 PPIBP23284 216 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 PAX3P23760 479 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 GPR1P46091 355 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 RRM2BQ7LG56 351 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 FIBINQ8TAL6 211 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC5A11Q8WWX8 675 aa16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1-201ENST00000155840 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms