RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 PAHP00439 452 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 IL1RNP18510 177 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 RFX3P48380 749 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 TMEM145Q8NBT3 493 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 HMGB4Q8WW32 186 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 C1orf226A1L170 272 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 H3BSH0 61 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 PPM1DO15297 605 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 IFNA14P01570 189 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 SEMG1P04279 462 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 FCN2Q15485 313 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 TCTN1Q2MV58 587 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 GPR33Q49SQ1 333 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 ANKRD54Q6NXT1 300 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 SLC30A6Q6NXT4 461 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 TPRG1Q6ZUI0 275 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 SYT9Q86SS6 491 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 L3MBTL4Q8NA19 623 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 SIMC1Q8NDZ2 872 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 SLC38A5Q8WUX1 472 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 TMEM245Q9H330 911 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CTDP1-201ENST00000075430 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 HRGP04196 525 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 MSL3P1P0C860 447 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ASMTP46597 345 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 RPS7P62081 194 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF763Q0D2J5 394 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 MPEG1Q2M385 716 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 KLHL12Q53G59 568 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 LRRTM4Q86VH4 590 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 NEIL3Q8TAT5 605 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 SLC6A18Q96N87 628 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 FOPNLQ96NB1 174 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 FCRL4Q96PJ5 515 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 F2RL3Q96RI0 385 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 SLA2Q9H6Q3 261 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 EXTL2Q9UBQ6 330 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ZAR1LA6NP61 321 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 TBPL1P62380 186 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 FABP5Q01469 135 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 IRF5Q13568 498 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 MZT2BQ6NZ67 158 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 FAM109AQ8N4B1 249 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 OR4D11Q8NGI4 311 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 OR4C15Q8NGM1 316 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 PMEPA1Q969W9 287 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 RNFT2Q96EX2 444 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 RDH14Q9HBH5 336 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ASAH2Q9NR71 780 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 MGAT4AQ9UM21 535 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 OSMP13725 252 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 XCR1P46094 333 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 SLC6A12P48065 614 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 DGKGP49619 791 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 CHRNEQ04844 493 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 RPA4Q13156 261 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 CHMP1BQ7LBR1 199 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 KLBQ86Z14 1044 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 PEX5LQ8IYB4 626 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 UXS1Q8NBZ7 420 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 OR4M2Q8NGB6 313 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 OR52N2Q8NGI0 321 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 CDCA4Q9BXL8 241 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 C1GALT1Q9NS00 363 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 NUDT15Q9NV35 164 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 DYRK1BQ9Y463 629 aa15.89■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 OPRD1P41143 372 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 SLC9A3P48764 834 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 DCDC1P59894 354 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 HTRA3P83110 453 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 OR4K5Q8NGD3 323 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 OR52I1Q8NGK6 324 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF461Q8TAF7 563 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 C16orf78Q8WTQ4 265 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 MED28Q9H204 178 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ATG2BQ96BY7 2078 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 PRMT3O60678 531 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ARSBP15848 533 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF697Q5TEC3 545 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 TCTN3Q6NUS6 607 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDP1-201ENST00000075430 PODNL1Q6PEZ8 512 aa15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms