RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 RUNX2Q13950 521 aa22.56■■□□□ 1.2
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RPUSD1-201ENST00000007264 Q7L0L9 218 aa22.56■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 CAMKK1Q8N5S9 505 aa22.56■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 OR4K14Q8NGD5 310 aa22.56■■□□□ 1.2
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RPUSD1-201ENST00000007264 COL21A1Q96P44 957 aa22.56■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 UBXN7O94888 489 aa22.56■■□□□ 1.2
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RPUSD1-201ENST00000007264 HLCSP50747 726 aa22.56■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
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RPUSD1-201ENST00000007264 CD247P20963 164 aa22.55■■□□□ 1.2
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RPUSD1-201ENST00000007264 SLC22A7Q9Y694 548 aa22.55■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 J3KTA2 159 aa22.54■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 IL7RP16871 459 aa22.54■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 RYKP34925 604 aa22.54■■□□□ 1.2
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RPUSD1-201ENST00000007264 MEP1AQ16819 746 aa22.54■■□□□ 1.2
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RPUSD1-201ENST00000007264 OR10G2Q8NGC3 310 aa22.54■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 BBS10Q8TAM1 723 aa22.54■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 KAT2AQ92830 837 aa22.54■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 CSF3RQ99062 836 aa22.54■■□□□ 1.2
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RPUSD1-201ENST00000007264 EQTNQ9NQ60 294 aa22.54■■□□□ 1.2
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RPUSD1-201ENST00000007264 GMPPBQ9Y5P6 360 aa22.54■■□□□ 1.2
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RPUSD1-201ENST00000007264 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa22.54■■□□□ 1.2
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RPUSD1-201ENST00000007264 APOL4Q9BPW4 351 aa22.54■■□□□ 1.2
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RPUSD1-201ENST00000007264 LGI4Q8N135 537 aa22.53■■□□□ 1.2
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RPUSD1-201ENST00000007264 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
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RPUSD1-201ENST00000007264 GPR32P1Q8NGA4 272 aa22.53■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa22.53■■□□□ 1.2
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RPUSD1-201ENST00000007264 IL21RQ9HBE5 538 aa22.53■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 NINQ8N4C6 2090 aa22.52■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 B4GAT1O43505 415 aa22.52■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 GSTT1P30711 240 aa22.52■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 CLK3P49761 638 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 NPRL3Q12980 569 aa22.52■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC36A4Q6YBV0 504 aa22.52■■□□□ 1.2
RPUSD1-201ENST00000007264 PRSS41Q7RTY9 318 aa22.52■■□□□ 1.2
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