RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	18.53	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	ST5	P78524	1137 aa		18.53	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	DCTN1	Q14203	1278 aa		18.53	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	NBPF15	Q8N660	670 aa		18.53	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	CNKSR1	Q969H4	720 aa		18.53	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		18.52	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	HTRA3	P83110	453 aa		18.52	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	JMY	Q8N9B5	988 aa		18.52	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	KLRG1	Q96E93	195 aa		18.52	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	MASTL	Q96GX5	879 aa		18.52	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		18.52	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
MUC1-222	ENST00000610468	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
MUC1-222	ENST00000610468	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		18.51	■□□□□ 0.55
MUC1-222	ENST00000610468	POTEC	B2RU33	542 aa		18.5	■□□□□ 0.55
MUC1-222	ENST00000610468	NPHP1	O15259	732 aa		18.5	■□□□□ 0.55
MUC1-222	ENST00000610468	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
MUC1-222	ENST00000610468	SOGA3	Q5TF21	947 aa		18.5	■□□□□ 0.55
MUC1-222	ENST00000610468	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
MUC1-222	ENST00000610468	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		18.5	■□□□□ 0.55
MUC1-222	ENST00000610468	ERFE	Q4G0M1	354 aa		18.49	■□□□□ 0.55
MUC1-222	ENST00000610468	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		18.48	■□□□□ 0.55
MUC1-222	ENST00000610468	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		18.48	■□□□□ 0.55
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
MUC1-222	ENST00000610468	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		18.48	■□□□□ 0.55
MUC1-222	ENST00000610468	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	18.47	■□□□□ 0.55
MUC1-222	ENST00000610468	NPR1	P16066	1061 aa		18.46	■□□□□ 0.55
MUC1-222	ENST00000610468	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		18.46	■□□□□ 0.55
MUC1-222	ENST00000610468	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
MUC1-222	ENST00000610468	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MUC1-222	ENST00000610468	SLX4	Q8IY92	1834 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MUC1-222	ENST00000610468	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		18.45	■□□□□ 0.54
MUC1-222	ENST00000610468	HLF	Q16534	295 aa		18.44	■□□□□ 0.54
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC93	Q567U6	631 aa		18.44	■□□□□ 0.54
MUC1-222	ENST00000610468	NEFM	P07197	916 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MUC1-222	ENST00000610468	NFE2L2	Q16236	605 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MUC1-222	ENST00000610468	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MUC1-222	ENST00000610468	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MUC1-222	ENST00000610468	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
MUC1-222	ENST00000610468	CRY2	Q49AN0	593 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MUC1-222	ENST00000610468	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
MUC1-222	ENST00000610468	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MUC1-222	ENST00000610468	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
MUC1-222	ENST00000610468	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	18.41	■□□□□ 0.54
MUC1-222	ENST00000610468	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
MUC1-222	ENST00000610468	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
MUC1-222	ENST00000610468	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MUC1-222	ENST00000610468	SNED1	Q8TER0	1413 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MUC1-222	ENST00000610468	PCNT	O95613	3336 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MUC1-222	ENST00000610468	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
MUC1-222	ENST00000610468	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MUC1-222	ENST00000610468	ABCC12	Q96J65	1359 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MUC1-222	ENST00000610468	CHADL	Q6NUI6	762 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		18.38	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	FAM177B	A6PVY3	158 aa		18.38	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	ALDH1B1	P30837	517 aa		18.38	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	OLFM4	Q6UX06	510 aa		18.38	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	NYX	Q9GZU5	481 aa		18.38	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	ERBB4	Q15303	1308 aa		18.38	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	POTEI	P0CG38	1075 aa		18.37	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	POTEJ	P0CG39	1038 aa		18.37	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		18.37	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		18.37	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		18.36	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		18.36	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		18.36	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		18.35	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	LDHD	Q86WU2	507 aa		18.35	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		18.35	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	NGEF	Q8N5V2	710 aa		18.35	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	PSMD1	Q99460	953 aa		18.35	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	CREBZF	Q9NS37	354 aa		18.35	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	FZD9	O00144	591 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	CACNA1S	Q13698	1873 aa		18.33	■□□□□ 0.53
MUC1-222	ENST00000610468	MYL6B	P14649	208 aa		18.33	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		18.33	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	PASK	Q96RG2	1323 aa		18.32	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	NTSR2	O95665	410 aa		18.32	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	GPT	P24298	496 aa		18.32	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	PDIA6	Q15084	440 aa		18.32	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	RALBP1	Q15311	655 aa		18.32	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	SUSD4	Q5VX71	490 aa		18.32	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	SYNE4	Q8N205	404 aa		18.32	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		18.32	■□□□□ 0.52

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