RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.08■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.07■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 KRT27Q7Z3Y8 459 aa23.07■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 SLC39A6Q13433 755 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 POLA2Q14181 598 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 PROSER3Q2NL68 480 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 FAM182BQ5T319 152 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 PIGBQ92521 554 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 PAPPAQ13219 1627 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 PDE1AP54750 535 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 LINS1Q8NG48 757 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 AOX1Q06278 1338 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.03■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.03■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 PDIA6Q15084 440 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 BCL11AQ9H165 835 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 SBF2Q86WG5 1849 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 KCNQ2O43526 872 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SPNS3-204ENST00000575194 SALL3Q9BXA9 1300 aa23.02■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 SRGAP3O43295 1099 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 SDSP20132 328 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 MX1P20591 662 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 MTX1Q13505 466 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 HSCBQ8IWL3 235 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 NEXNQ0ZGT2 675 aa23■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 ERBB4Q15303 1308 aa23■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 UTYO14607 1347 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 STAP2Q9UGK3 403 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 SNX21Q969T3 373 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 ATG3Q9NT62 314 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 GRM8O00222 908 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 NHSQ6T4R5 1651 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 REC8O95072 547 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 MYL6BP14649 208 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS3-204ENST00000575194 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 COPS6Q7L5N1 327 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 USP16Q9Y5T5 823 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 ERC2O15083 957 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 NFKBIBQ15653 356 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 BTAF1O14981 1849 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 AK9Q5TCS8 1911 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 IGKV5-2P06315 115 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 MYD88Q99836 296 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 USP26Q9BXU7 913 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 GCKRQ14397 625 aa22.89■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 KIF2CQ99661 725 aa22.89■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.89■■□□□ 1.26
SPNS3-204ENST00000575194 COL15A1P39059 1388 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS3-204ENST00000575194 RABEP1Q15276 862 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS3-204ENST00000575194 SUCLG2Q96I99 432 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS3-204ENST00000575194 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SPNS3-204ENST00000575194 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS3-204ENST00000575194 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS3-204ENST00000575194 TRIM37O94972 964 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS3-204ENST00000575194 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS3-204ENST00000575194 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS3-204ENST00000575194 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SPNS3-204ENST00000575194 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS3-204ENST00000575194 GPATCH3Q96I76 525 aa22.87■■□□□ 1.25
SPNS3-204ENST00000575194 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.87■■□□□ 1.25
SPNS3-204ENST00000575194 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SPNS3-204ENST00000575194 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SPNS3-204ENST00000575194 PALLDQ8WX93 1383 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS3-204ENST00000575194 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.85■■□□□ 1.25
SPNS3-204ENST00000575194 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms