RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567283.5

RPUSD1-209, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, human

TSL 3

Gene RPUSD1, Length 835 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPUSD1-209	ENST00000567283	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		32.6	■■■□□ 2.81
RPUSD1-209	ENST00000567283	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
RPUSD1-209	ENST00000567283	C21orf2	O43822	256 aa		32.6	■■■□□ 2.81
RPUSD1-209	ENST00000567283	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
RPUSD1-209	ENST00000567283	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.81
RPUSD1-209	ENST00000567283	GLTPD2	A6NH11	291 aa		32.57	■■■□□ 2.8
RPUSD1-209	ENST00000567283	SLX4	Q8IY92	1834 aa		32.56	■■■□□ 2.8
RPUSD1-209	ENST00000567283	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		32.56	■■■□□ 2.8
RPUSD1-209	ENST00000567283	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
RPUSD1-209	ENST00000567283	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		32.55	■■■□□ 2.8
RPUSD1-209	ENST00000567283	IFFO2	Q5TF58	517 aa		32.54	■■■□□ 2.8
RPUSD1-209	ENST00000567283	CNKSR1	Q969H4	720 aa		32.54	■■■□□ 2.8
RPUSD1-209	ENST00000567283	HTRA3	P83110	453 aa		32.53	■■■□□ 2.8
RPUSD1-209	ENST00000567283	STYK1	Q6J9G0	422 aa		32.53	■■■□□ 2.8
RPUSD1-209	ENST00000567283	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
RPUSD1-209	ENST00000567283	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		32.53	■■■□□ 2.8
RPUSD1-209	ENST00000567283	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		32.53	■■■□□ 2.8
RPUSD1-209	ENST00000567283	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
RPUSD1-209	ENST00000567283	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		32.52	■■■□□ 2.8
RPUSD1-209	ENST00000567283	NBPF26	B4DH59	902 aa		32.51	■■■□□ 2.79
RPUSD1-209	ENST00000567283	SRGN	P10124	158 aa		32.51	■■■□□ 2.79
RPUSD1-209	ENST00000567283	ERFE	Q4G0M1	354 aa		32.51	■■■□□ 2.79
RPUSD1-209	ENST00000567283	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
RPUSD1-209	ENST00000567283	NBPF15	Q8N660	670 aa		32.51	■■■□□ 2.79
RPUSD1-209	ENST00000567283	MASTL	Q96GX5	879 aa		32.51	■■■□□ 2.79
RPUSD1-209	ENST00000567283	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	32.51	■■■□□ 2.79
RPUSD1-209	ENST00000567283	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		32.5	■■■□□ 2.79
RPUSD1-209	ENST00000567283	FAM177B	A6PVY3	158 aa		32.49	■■■□□ 2.79
RPUSD1-209	ENST00000567283	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		32.49	■■■□□ 2.79
RPUSD1-209	ENST00000567283	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		32.49	■■■□□ 2.79
RPUSD1-209	ENST00000567283	SOGA3	Q5TF21	947 aa		32.48	■■■□□ 2.79
RPUSD1-209	ENST00000567283	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
RPUSD1-209	ENST00000567283	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		32.47	■■■□□ 2.79
RPUSD1-209	ENST00000567283	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		32.45	■■■□□ 2.79
RPUSD1-209	ENST00000567283	NGEF	Q8N5V2	710 aa		32.45	■■■□□ 2.79
RPUSD1-209	ENST00000567283	NFE2L2	Q16236	605 aa		32.44	■■■□□ 2.78
RPUSD1-209	ENST00000567283	KLRG1	Q96E93	195 aa		32.44	■■■□□ 2.78
RPUSD1-209	ENST00000567283	NPR1	P16066	1061 aa		32.43	■■■□□ 2.78
RPUSD1-209	ENST00000567283	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
RPUSD1-209	ENST00000567283	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
RPUSD1-209	ENST00000567283	RGL2	O15211	777 aa		32.42	■■■□□ 2.78
RPUSD1-209	ENST00000567283	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		32.42	■■■□□ 2.78
RPUSD1-209	ENST00000567283	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
RPUSD1-209	ENST00000567283	NUP98	P52948	1817 aa		32.42	■■■□□ 2.78
RPUSD1-209	ENST00000567283	HLF	Q16534	295 aa		32.41	■■■□□ 2.78
RPUSD1-209	ENST00000567283	CCDC93	Q567U6	631 aa		32.41	■■■□□ 2.78
RPUSD1-209	ENST00000567283	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		32.39	■■■□□ 2.78
RPUSD1-209	ENST00000567283	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
RPUSD1-209	ENST00000567283	MYL6B	P14649	208 aa		32.37	■■■□□ 2.77
RPUSD1-209	ENST00000567283	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
RPUSD1-209	ENST00000567283	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		32.35	■■■□□ 2.77
RPUSD1-209	ENST00000567283	POTEC	B2RU33	542 aa		32.35	■■■□□ 2.77
RPUSD1-209	ENST00000567283	RALBP1	Q15311	655 aa		32.35	■■■□□ 2.77
RPUSD1-209	ENST00000567283	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
RPUSD1-209	ENST00000567283	NYX	Q9GZU5	481 aa		32.34	■■■□□ 2.77
RPUSD1-209	ENST00000567283	ABCC12	Q96J65	1359 aa		32.33	■■■□□ 2.77
RPUSD1-209	ENST00000567283	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
RPUSD1-209	ENST00000567283	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		32.32	■■■□□ 2.76
RPUSD1-209	ENST00000567283	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	32.32	■■■□□ 2.76
RPUSD1-209	ENST00000567283	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		32.32	■■■□□ 2.76
RPUSD1-209	ENST00000567283	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		32.32	■■■□□ 2.76
RPUSD1-209	ENST00000567283	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		32.32	■■■□□ 2.76
RPUSD1-209	ENST00000567283	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		32.32	■■■□□ 2.76
RPUSD1-209	ENST00000567283	GPT	P24298	496 aa		32.31	■■■□□ 2.76
RPUSD1-209	ENST00000567283	OLFM4	Q6UX06	510 aa		32.31	■■■□□ 2.76
RPUSD1-209	ENST00000567283	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		32.31	■■■□□ 2.76
RPUSD1-209	ENST00000567283	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
RPUSD1-209	ENST00000567283	ALDH1B1	P30837	517 aa		32.3	■■■□□ 2.76
RPUSD1-209	ENST00000567283	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
RPUSD1-209	ENST00000567283	JMY	Q8N9B5	988 aa		32.3	■■■□□ 2.76
RPUSD1-209	ENST00000567283	SCN4A	P35499	1836 aa		32.28	■■■□□ 2.76
RPUSD1-209	ENST00000567283	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		32.28	■■■□□ 2.76
RPUSD1-209	ENST00000567283	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		32.27	■■■□□ 2.76
RPUSD1-209	ENST00000567283	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
RPUSD1-209	ENST00000567283	RIPK4	P57078	832 aa		32.26	■■■□□ 2.75
RPUSD1-209	ENST00000567283	CHADL	Q6NUI6	762 aa		32.26	■■■□□ 2.75
RPUSD1-209	ENST00000567283	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
RPUSD1-209	ENST00000567283	ERBB4	Q15303	1308 aa		32.26	■■■□□ 2.75
RPUSD1-209	ENST00000567283	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		32.26	■■■□□ 2.75
RPUSD1-209	ENST00000567283	PCNT	O95613	3336 aa		32.25	■■■□□ 2.75
RPUSD1-209	ENST00000567283	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		32.24	■■■□□ 2.75
RPUSD1-209	ENST00000567283	POTEI	P0CG38	1075 aa		32.23	■■■□□ 2.75
RPUSD1-209	ENST00000567283	POTEJ	P0CG39	1038 aa		32.23	■■■□□ 2.75
RPUSD1-209	ENST00000567283	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
RPUSD1-209	ENST00000567283	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		32.23	■■■□□ 2.75
RPUSD1-209	ENST00000567283	CRY2	Q49AN0	593 aa		32.23	■■■□□ 2.75
RPUSD1-209	ENST00000567283	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		32.23	■■■□□ 2.75
RPUSD1-209	ENST00000567283	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
RPUSD1-209	ENST00000567283	SUSD4	Q5VX71	490 aa		32.21	■■■□□ 2.75
RPUSD1-209	ENST00000567283	SYNE4	Q8N205	404 aa		32.21	■■■□□ 2.75
RPUSD1-209	ENST00000567283	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
RPUSD1-209	ENST00000567283	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.74
RPUSD1-209	ENST00000567283	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		32.19	■■■□□ 2.74
RPUSD1-209	ENST00000567283	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
RPUSD1-209	ENST00000567283	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
RPUSD1-209	ENST00000567283	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
RPUSD1-209	ENST00000567283	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		32.18	■■■□□ 2.74
RPUSD1-209	ENST00000567283	LDHD	Q86WU2	507 aa		32.18	■■■□□ 2.74
RPUSD1-209	ENST00000567283	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
RPUSD1-209	ENST00000567283	NTSR2	O95665	410 aa		32.17	■■■□□ 2.74

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