RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 SLC30A3Q99726 388 aa7.32□□□□□ -1.24
FAM227B-211ENST00000560557 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa7.32□□□□□ -1.24
FAM227B-211ENST00000560557 LILRB5O75023 590 aa7.31□□□□□ -1.24
FAM227B-211ENST00000560557 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
FAM227B-211ENST00000560557 RAC1P63000 192 aa7.31□□□□□ -1.24
FAM227B-211ENST00000560557 LCE4AQ5TA78 99 aa7.3□□□□□ -1.24
FAM227B-211ENST00000560557 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.3□□□□□ -1.24
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.3□□□□□ -1.24
FAM227B-211ENST00000560557 RFC5P40937 340 aa7.29□□□□□ -1.24
FAM227B-211ENST00000560557 GP2P55259 537 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
FAM227B-211ENST00000560557 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
FAM227B-211ENST00000560557 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.29□□□□□ -1.24
FAM227B-211ENST00000560557 SCNN1DP51172 638 aa7.28□□□□□ -1.24
FAM227B-211ENST00000560557 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.28□□□□□ -1.24
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
FAM227B-211ENST00000560557 MED26O95402 600 aa7.27□□□□□ -1.25
FAM227B-211ENST00000560557 INHAP05111 366 aa7.27□□□□□ -1.25
FAM227B-211ENST00000560557 ILDR2Q71H61 639 aa7.27□□□□□ -1.25
FAM227B-211ENST00000560557 MEGF10Q96KG7 1140 aa7.27□□□□□ -1.25
FAM227B-211ENST00000560557 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
FAM227B-211ENST00000560557 FSTP19883 344 aa7.26□□□□□ -1.25
FAM227B-211ENST00000560557 NOS3P29474 1203 aa7.26□□□□□ -1.25
FAM227B-211ENST00000560557 IREB2P48200 963 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
FAM227B-211ENST00000560557 SMTNP53814 917 aa7.26□□□□□ -1.25
FAM227B-211ENST00000560557 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
FAM227B-211ENST00000560557 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.26□□□□□ -1.25
FAM227B-211ENST00000560557 SLC51AQ86UW1 340 aa7.26□□□□□ -1.25
FAM227B-211ENST00000560557 GDF10P55107 478 aa7.25□□□□□ -1.25
FAM227B-211ENST00000560557 TSGA10IPQ3SY00 556 aa7.25□□□□□ -1.25
FAM227B-211ENST00000560557 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
FAM227B-211ENST00000560557 SLC24A3Q9HC58 644 aa7.25□□□□□ -1.25
FAM227B-211ENST00000560557 CEP126Q9P2H0 1117 aa7.25□□□□□ -1.25
FAM227B-211ENST00000560557 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
FAM227B-211ENST00000560557 USP3Q9Y6I4 520 aa7.25□□□□□ -1.25
FAM227B-211ENST00000560557 SPEM2Q0P670 501 aa7.24□□□□□ -1.25
FAM227B-211ENST00000560557 USP4Q13107 963 aa7.24□□□□□ -1.25
FAM227B-211ENST00000560557 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
FAM227B-211ENST00000560557 GPR37L1O60883 481 aa7.22□□□□□ -1.25
FAM227B-211ENST00000560557 TXLNAP40222 546 aa7.22□□□□□ -1.25
FAM227B-211ENST00000560557 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
FAM227B-211ENST00000560557 CDK2AP1O14519 115 aa7.21□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 ADAMTS4O75173 837 aa7.21□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7.21□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 NUDT8Q8WV74 236 aa7.21□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 CABP1Q9NZU7 370 aa7.21□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 DOLKQ9UPQ8 538 aa7.21□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 NEUROD1Q13562 356 aa7.2□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 MTFR1Q15390 333 aa7.2□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.2□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 PHTF2Q8N3S3 785 aa7.18□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.18□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.18□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 SLC6A14Q9UN76 642 aa7.18□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 A6NJY4 79 aa7.17□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 TGFB1P01137 390 aa7.17□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM259Q4ZIN3 620 aa7.17□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 FBXO11Q86XK2 927 aa7.17□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.16□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 DTWD1Q8N5C7 304 aa7.16□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 C7orf43Q8WVR3 580 aa7.16□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.15□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 EML1O00423 815 aa7.15□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 SLC24A1O60721 1099 aa7.15□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 SPINK2P20155 84 aa7.15□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa7.15□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 OGFOD2Q6N063 350 aa7.15□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa7.15□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.15□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 SIRT1Q96EB6 747 aa7.15□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 BCANQ96GW7 911 aa7.15□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 FAM117AQ9C073 453 aa7.15□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
FAM227B-211ENST00000560557 SOCS7O14512 581 aa7.14□□□□□ -1.27
FAM227B-211ENST00000560557 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.14□□□□□ -1.27
FAM227B-211ENST00000560557 DDRGK1Q96HY6 314 aa7.14□□□□□ -1.27
FAM227B-211ENST00000560557 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.14□□□□□ -1.27
FAM227B-211ENST00000560557 NAGPAQ9UK23 515 aa7.14□□□□□ -1.27
FAM227B-211ENST00000560557 C8AP07357 584 aa7.13□□□□□ -1.27
FAM227B-211ENST00000560557 KCNQ4P56696 695 aa7.13□□□□□ -1.27
FAM227B-211ENST00000560557 MSL1Q68DK7 614 aa7.13□□□□□ -1.27
FAM227B-211ENST00000560557 BHMTQ93088 406 aa7.13□□□□□ -1.27
FAM227B-211ENST00000560557 BRD7Q9NPI1 651 aa7.13□□□□□ -1.27
FAM227B-211ENST00000560557 CHIC2Q9UKJ5 165 aa7.13□□□□□ -1.27
FAM227B-211ENST00000560557 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.12□□□□□ -1.27
FAM227B-211ENST00000560557 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
FAM227B-211ENST00000560557 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
FAM227B-211ENST00000560557 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
FAM227B-211ENST00000560557 IGLV1-40P01703 118 aa7.11□□□□□ -1.27
FAM227B-211ENST00000560557 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.11□□□□□ -1.27
FAM227B-211ENST00000560557 IGFLR1Q9H665 355 aa7.11□□□□□ -1.27
FAM227B-211ENST00000560557 GSC2O15499 205 aa7.1□□□□□ -1.27
FAM227B-211ENST00000560557 AKTIPQ9H8T0 292 aa7.1□□□□□ -1.27
FAM227B-211ENST00000560557 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.1□□□□□ -1.27
FAM227B-211ENST00000560557 GRIK5Q16478 980 aa7.09□□□□□ -1.27
FAM227B-211ENST00000560557 SLFNL1Q499Z3 407 aa7.09□□□□□ -1.27
FAM227B-211ENST00000560557 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.09□□□□□ -1.27
FAM227B-211ENST00000560557 CEP63Q96MT8 703 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms