RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557172.5

KLC1-223, Transcript of kinesin light chain 1, human

TSL 4

Gene KLC1, Length 540 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KLC1-223	ENST00000557172	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
KLC1-223	ENST00000557172	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
KLC1-223	ENST00000557172	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		12.4	□□□□□ -0.42
KLC1-223	ENST00000557172	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		12.4	□□□□□ -0.42
KLC1-223	ENST00000557172	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		12.4	□□□□□ -0.42
KLC1-223	ENST00000557172	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		12.4	□□□□□ -0.42
KLC1-223	ENST00000557172	ARX	Q96QS3	562 aa		12.4	□□□□□ -0.42
KLC1-223	ENST00000557172	CRBN	Q96SW2	442 aa		12.4	□□□□□ -0.42
KLC1-223	ENST00000557172	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		12.4	□□□□□ -0.42
KLC1-223	ENST00000557172	COG6	Q9Y2V7	657 aa		12.4	□□□□□ -0.42
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
KLC1-223	ENST00000557172	NHS	Q6T4R5	1651 aa		12.4	□□□□□ -0.42
KLC1-223	ENST00000557172	ABCC4	O15439	1325 aa		12.39	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172		A0A087WZG4	1122 aa		12.39	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		12.39	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		12.39	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	12.39	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		12.38	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	12.38	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	12.38	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		12.38	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		12.38	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		12.38	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	12.38	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		12.38	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	12.38	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		12.38	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		12.38	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		12.37	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	GNPAT	O15228	680 aa		12.37	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		12.37	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	AAMP	Q13685	434 aa		12.37	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	AK7	Q96M32	723 aa		12.37	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		12.37	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		12.37	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	ADCY9	O60503	1353 aa		12.36	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	ALDH1L1	O75891	902 aa		12.36	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		12.36	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	BEND3	Q5T5X7	828 aa		12.36	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	LINS1	Q8NG48	757 aa		12.36	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		12.36	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		12.36	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	CASZ1	Q86V15	1759 aa		12.35	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	TCIRG1	Q13488	830 aa		12.35	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		12.35	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	MYD88	Q99836	296 aa		12.35	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	BTAF1	O14981	1849 aa		12.34	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
KLC1-223	ENST00000557172	RGL2	O15211	777 aa		12.33	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	ZPR1	O75312	459 aa		12.33	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	CAMTA2	O94983	1202 aa		12.33	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	IGKV5-2	P06315	115 aa		12.33	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	GNAI3	P08754	354 aa		12.33	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	SSFA2	P28290	1259 aa		12.33	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	RFC4	P35249	363 aa		12.33	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		12.33	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		12.33	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	AKT1S1	Q96B36	256 aa		12.33	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		12.33	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		12.33	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	NARF	Q9UHQ1	456 aa		12.33	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	C5	P01031	1676 aa		12.32	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	COL15A1	P39059	1388 aa		12.32	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		12.32	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		12.32	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	HLF	Q16534	295 aa		12.32	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	SMIM5	Q71RC9	77 aa		12.32	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		12.32	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	USP44	Q9H0E7	712 aa		12.32	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		12.32	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		12.32	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		12.32	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		12.32	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	ATP10D	Q9P241	1426 aa		12.31	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	PHF14	O94880	888 aa		12.31	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	GCKR	Q14397	625 aa		12.31	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		12.31	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	STK32B	Q9NY57	414 aa		12.31	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF827	Q17R98	1081 aa		12.3	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		12.3	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		12.3	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		12.3	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	MEIS3	Q99687	375 aa		12.3	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	TJP1	Q07157	1748 aa		12.3	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
KLC1-223	ENST00000557172	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		12.29	□□□□□ -0.44

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms