RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555540.1

KRT18P6-201, Transcript of keratin 18 pseudogene 6, humanhuman

BASIC

Gene KRT18P6, Length 1,265 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P6-201ENST00000555540 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
KRT18P6-201ENST00000555540 NPHP1O15259 732 aa27.2■■□□□ 1.94
KRT18P6-201ENST00000555540 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
KRT18P6-201ENST00000555540 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
KRT18P6-201ENST00000555540 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa27.2■■□□□ 1.94
KRT18P6-201ENST00000555540 SLX4Q8IY92 1834 aa27.18■■□□□ 1.94
KRT18P6-201ENST00000555540 CLEC4GQ6UXB4 293 aa27.18■■□□□ 1.94
KRT18P6-201ENST00000555540 CNKSR1Q969H4 720 aa27.18■■□□□ 1.94
KRT18P6-201ENST00000555540 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
KRT18P6-201ENST00000555540 DCTN1Q14203 1278 aa27.17■■□□□ 1.94
KRT18P6-201ENST00000555540 STYK1Q6J9G0 422 aa27.17■■□□□ 1.94
KRT18P6-201ENST00000555540 PCNTO95613 3336 aa27.17■■□□□ 1.94
KRT18P6-201ENST00000555540 LTBP3Q9NS15 1303 aa27.16■■□□□ 1.94
KRT18P6-201ENST00000555540 SRGNP10124 158 aa27.16■■□□□ 1.94
KRT18P6-201ENST00000555540 DPY19L2Q6NUT2 758 aa27.16■■□□□ 1.94
KRT18P6-201ENST00000555540 JMYQ8N9B5 988 aa27.16■■□□□ 1.94
KRT18P6-201ENST00000555540 ERFEQ4G0M1 354 aa27.15■■□□□ 1.94
KRT18P6-201ENST00000555540 MASTLQ96GX5 879 aa27.15■■□□□ 1.94
KRT18P6-201ENST00000555540 ZNF652Q9Y2D9 606 aa27.15■■□□□ 1.94
KRT18P6-201ENST00000555540 POTECB2RU33 542 aa27.14■■□□□ 1.94
KRT18P6-201ENST00000555540 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
KRT18P6-201ENST00000555540 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
KRT18P6-201ENST00000555540 TAOK3Q9H2K8 898 aa27.14■■□□□ 1.94
KRT18P6-201ENST00000555540 NBPF26B4DH59 902 aa27.12■■□□□ 1.93
KRT18P6-201ENST00000555540 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
KRT18P6-201ENST00000555540 SOGA3Q5TF21 947 aa27.12■■□□□ 1.93
KRT18P6-201ENST00000555540 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
KRT18P6-201ENST00000555540 NBPF15Q8N660 670 aa27.12■■□□□ 1.93
KRT18P6-201ENST00000555540 LAMB4A4D0S4 1761 aa27.12■■□□□ 1.93
KRT18P6-201ENST00000555540 RGL2O15211 777 aa27.11■■□□□ 1.93
KRT18P6-201ENST00000555540 DLG5Q8TDM6 1919 aa27.11■■□□□ 1.93
KRT18P6-201ENST00000555540 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.09■■□□□ 1.93
KRT18P6-201ENST00000555540 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
KRT18P6-201ENST00000555540 KDM3BQ7LBC6 1761 aa27.07■■□□□ 1.92
KRT18P6-201ENST00000555540 NPR1P16066 1061 aa27.07■■□□□ 1.92
KRT18P6-201ENST00000555540 TPTE2Q6XPS3 522 aa27.07■■□□□ 1.92
KRT18P6-201ENST00000555540 C7orf43Q8WVR3 580 aa27.07■■□□□ 1.92
KRT18P6-201ENST00000555540 MIS18AQ9NYP9 233 aa27.07■■□□□ 1.92
KRT18P6-201ENST00000555540 NEFMP07197 916 aa27.05■■□□□ 1.92
KRT18P6-201ENST00000555540 HLFQ16534 295 aa27.04■■□□□ 1.92
KRT18P6-201ENST00000555540 CCDC93Q567U6 631 aa27.04■■□□□ 1.92
KRT18P6-201ENST00000555540 DDNO94850 711 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
KRT18P6-201ENST00000555540 FAM177BA6PVY3 158 aa27.02■■□□□ 1.92
KRT18P6-201ENST00000555540 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
KRT18P6-201ENST00000555540 PLEKHF1Q96S99 279 aa27.01■■□□□ 1.91
KRT18P6-201ENST00000555540 NUP98P52948 1817 aa27.01■■□□□ 1.91
KRT18P6-201ENST00000555540 SCN4AP35499 1836 aa27■■□□□ 1.91
KRT18P6-201ENST00000555540 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.99■■□□□ 1.91
KRT18P6-201ENST00000555540 CHADLQ6NUI6 762 aa26.99■■□□□ 1.91
KRT18P6-201ENST00000555540 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.98■■□□□ 1.91
KRT18P6-201ENST00000555540 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
KRT18P6-201ENST00000555540 ALDH1B1P30837 517 aa26.98■■□□□ 1.91
KRT18P6-201ENST00000555540 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
KRT18P6-201ENST00000555540 NFE2L2Q16236 605 aa26.98■■□□□ 1.91
KRT18P6-201ENST00000555540 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
KRT18P6-201ENST00000555540 POTEIP0CG38 1075 aa26.97■■□□□ 1.91
KRT18P6-201ENST00000555540 POTEJP0CG39 1038 aa26.97■■□□□ 1.91
KRT18P6-201ENST00000555540 OLFM4Q6UX06 510 aa26.97■■□□□ 1.91
KRT18P6-201ENST00000555540 RTKN2Q8IZC4 609 aa26.97■■□□□ 1.91
KRT18P6-201ENST00000555540 NGEFQ8N5V2 710 aa26.97■■□□□ 1.91
KRT18P6-201ENST00000555540 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
KRT18P6-201ENST00000555540 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.96■■□□□ 1.91
KRT18P6-201ENST00000555540 NYXQ9GZU5 481 aa26.96■■□□□ 1.91
KRT18P6-201ENST00000555540 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
KRT18P6-201ENST00000555540 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.95■■□□□ 1.91
KRT18P6-201ENST00000555540 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
KRT18P6-201ENST00000555540 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
KRT18P6-201ENST00000555540 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.94■■□□□ 1.9
KRT18P6-201ENST00000555540 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
KRT18P6-201ENST00000555540 ABCC12Q96J65 1359 aa26.94■■□□□ 1.9
KRT18P6-201ENST00000555540 CRY2Q49AN0 593 aa26.93■■□□□ 1.9
KRT18P6-201ENST00000555540 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.93■■□□□ 1.9
KRT18P6-201ENST00000555540 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.93■■□□□ 1.9
KRT18P6-201ENST00000555540 CREBZFQ9NS37 354 aa26.93■■□□□ 1.9
KRT18P6-201ENST00000555540 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.92■■□□□ 1.9
KRT18P6-201ENST00000555540 MYL6BP14649 208 aa26.92■■□□□ 1.9
KRT18P6-201ENST00000555540 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
KRT18P6-201ENST00000555540 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.91■■□□□ 1.9
KRT18P6-201ENST00000555540 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
KRT18P6-201ENST00000555540 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
KRT18P6-201ENST00000555540 LDHDQ86WU2 507 aa26.91■■□□□ 1.9
KRT18P6-201ENST00000555540 SYNE4Q8N205 404 aa26.91■■□□□ 1.9
KRT18P6-201ENST00000555540 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
KRT18P6-201ENST00000555540 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.9■■□□□ 1.9
KRT18P6-201ENST00000555540 SNED1Q8TER0 1413 aa26.9■■□□□ 1.9
KRT18P6-201ENST00000555540 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
KRT18P6-201ENST00000555540 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.9■■□□□ 1.9
KRT18P6-201ENST00000555540 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.89■■□□□ 1.9
KRT18P6-201ENST00000555540 FZD9O00144 591 aa26.88■■□□□ 1.89
KRT18P6-201ENST00000555540 GPTP24298 496 aa26.88■■□□□ 1.89
KRT18P6-201ENST00000555540 PSMD1Q99460 953 aa26.88■■□□□ 1.89
KRT18P6-201ENST00000555540 ERBB4Q15303 1308 aa26.88■■□□□ 1.89
KRT18P6-201ENST00000555540 PASKQ96RG2 1323 aa26.88■■□□□ 1.89
KRT18P6-201ENST00000555540 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
KRT18P6-201ENST00000555540 HACL1Q9UJ83 578 aa26.87■■□□□ 1.89
KRT18P6-201ENST00000555540 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
KRT18P6-201ENST00000555540 SUSD4Q5VX71 490 aa26.86■■□□□ 1.89
KRT18P6-201ENST00000555540 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.86■■□□□ 1.89
KRT18P6-201ENST00000555540 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.86■■□□□ 1.89
KRT18P6-201ENST00000555540 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.4 ms