RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 HMMRO75330 724 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 IL2RBP14784 551 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 PIP4K2BP78356 416 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 SLC39A6Q13433 755 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 SHANK3Q9BYB0 1731 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 ADCY9O60503 1353 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 ANXA1P04083 346 aa9.59□□□□□ -0.87
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CS-204ENST00000546621 LHX8Q68G74 356 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 TTC5Q8N0Z6 440 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 DNAAF4Q8WXU2 420 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 HYPKQ9NX55 129 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-204ENST00000546621 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 PI4KAP2A4QPH2 592 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 PROSER3Q2NL68 480 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 BEND3Q5T5X7 828 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 USP44Q9H0E7 712 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 GLI3P10071 1580 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 SEC24BO95487 1268 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 PDIA6Q15084 440 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 BMP2KLQ5H9B9 411 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 FMNL2Q96PY5 1086 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 BTG4Q9NY30 223 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 PHLPP1O60346 1717 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 LAMB4A4D0S4 1761 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 ERVV-2B6SEH9 535 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 ATP8B2P98198 1209 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 TAF3Q5VWG9 929 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 KSR2Q6VAB6 950 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 PAPPAQ13219 1627 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 UBR2Q8IWV8 1755 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 TOM1O60784 492 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 DDX58O95786 925 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 DISP2A7MBM2 1401 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 PLCH1Q4KWH8 1693 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 ALDH1L1O75891 902 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 KIF20AO95235 890 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 KCPQ6ZWJ8 1503 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 DMTNQ08495 405 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 TNS2Q63HR2 1409 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 WNK3Q9BYP7 1800 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 APBB1O00213 710 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 MYL6BP14649 208 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 LRP10Q7Z4F1 713 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 LINS1Q8NG48 757 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 XAGE3Q8WTP9 111 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 TBC1D32Q96NH3 1257 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 PHF12Q96QT6 1004 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 USP16Q9Y5T5 823 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 ERBB4Q15303 1308 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 TTC22Q5TAA0 569 aa9.52□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 RIC3Q7Z5B4 369 aa9.52□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 NRAPQ86VF7 1730 aa9.52□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 SSH3Q8TE77 659 aa9.52□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 HDAC5Q9UQL6 1122 aa9.52□□□□□ -0.88
CS-204ENST00000546621 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 COPS6Q7L5N1 327 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 LRRCC1Q9C099 1032 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 LRP6O75581 1613 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 UTYO14607 1347 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 GRM8O00222 908 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 SRGAP3O43295 1099 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 RAB11FIP3O75154 756 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 NEXNQ0ZGT2 675 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 TMEM51Q9NW97 253 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-204ENST00000546621 TMOD3Q9NYL9 352 aa9.51□□□□□ -0.89
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