RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546585.1

CS-203, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,803 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-203ENST00000546585 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 RREB1Q92766 1687 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 AFF2P51816 1311 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 ALDH1L1O75891 902 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 BCL9O00512 1426 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 FMNL2Q96PY5 1086 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 BCL11AQ9H165 835 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 NHSQ6T4R5 1651 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 COL15A1P39059 1388 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 CASP7P55210 303 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 TTC22Q5TAA0 569 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 TTC5Q8N0Z6 440 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 LINS1Q8NG48 757 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 BTAF1O14981 1849 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 ERBB4Q15303 1308 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 COPS6Q7L5N1 327 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 TMOD3Q9NYL9 352 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 AK9Q5TCS8 1911 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 NEURL1BA8MQ27 555 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 PIGBQ92521 554 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 KIF2CQ99661 725 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 LY75O60449 1722 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 PDE1AP54750 535 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 SUCLG2Q96I99 432 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 ATG3Q9NT62 314 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 STAP2Q9UGK3 403 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 ASAP1Q9ULH1 1129 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 NUP98P52948 1817 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 TAF1LQ8IZX4 1826 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 GRM8O00222 908 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 HMMRO75330 724 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 MYL6BP14649 208 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 RBM25P49756 843 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 EPHA10Q5JZY3 1008 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 VSIG10Q8N0Z9 540 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 A1BGP04217 495 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 SDSP20132 328 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 GCKRQ14397 625 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 TTLL7Q6ZT98 887 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-203ENST00000546585 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 ANP32EQ9BTT0 268 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 SRGAP3O43295 1099 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 SLC4A3P48751 1232 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 TSHZ3Q63HK5 1081 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 PLBD2Q8NHP8 589 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 PI4K2BQ8TCG2 481 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 RHPN1Q8TCX5 695 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 LRRCC1Q9C099 1032 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 APBB1O00213 710 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 SASH1O94885 1247 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 DDX58O95786 925 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 MYD88Q99836 296 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 H7C1W4 665 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 CDC45O75419 566 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 RIC3Q7Z5B4 369 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 DNAJC10Q8IXB1 793 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 C22orf23Q9BZE7 217 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 AOX1Q06278 1338 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 MYH3P11055 1940 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 A0A0G2JS52 829 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 RAB11FIP3O75154 756 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 MX1P20591 662 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-203ENST00000546585 POTEAQ6S8J7 498 aa8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms