RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536509.5

LMO3-214, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 550 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-214ENST00000536509 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO3-214ENST00000536509 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO3-214ENST00000536509 IL17REQ8NFR9 667 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO3-214ENST00000536509 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 CFAP53Q96M91 514 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 BCORQ6W2J9 1755 aa14.88□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.88□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 SOGA3Q5TF21 947 aa14.88□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 SETDB2Q96T68 719 aa14.88□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 NFKBIEO00221 500 aa14.87□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.87□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 CNKSR1Q969H4 720 aa14.87□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.87□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 LTBP3Q9NS15 1303 aa14.87□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 BTBD11A6QL63 1104 aa14.86□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 NPHP1O15259 732 aa14.86□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 ST5P78524 1137 aa14.86□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.86□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 CNBD1Q8NA66 436 aa14.86□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 NUDCQ9Y266 331 aa14.86□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 CACNA1SQ13698 1873 aa14.85□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 RGL2O15211 777 aa14.85□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 PRELPP51888 382 aa14.85□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 ERFEQ4G0M1 354 aa14.85□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 STYK1Q6J9G0 422 aa14.85□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.85□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 C21orf2O43822 256 aa14.84□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 CAMTA2O94983 1202 aa14.84□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 A1BGP04217 495 aa14.84□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 HTRA3P83110 453 aa14.84□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 TAOK3Q9H2K8 898 aa14.84□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 SLX4Q8IY92 1834 aa14.84□□□□□ -0.03
LMO3-214ENST00000536509 PRKAR2BP31323 418 aa14.83□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 MASTLQ96GX5 879 aa14.83□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.83□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 SRGNP10124 158 aa14.82□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.82□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 SCN4AP35499 1836 aa14.82□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 POTECB2RU33 542 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 USP16Q9Y5T5 823 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 KCNQ3O43525 872 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 NPR1P16066 1061 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.79□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 CCDC93Q567U6 631 aa14.78□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 CHADLQ6NUI6 762 aa14.78□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.78□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.78□□□□□ -0.04
LMO3-214ENST00000536509 CREBZFQ9NS37 354 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 NEFMP07197 916 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 PPP2R1AP30153 589 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 ALDH1B1P30837 517 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 MCM10Q7L590 875 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 C7orf43Q8WVR3 580 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 PCNTO95613 3336 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 DDNO94850 711 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 TNS4Q8IZW8 715 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 NUP98P52948 1817 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 LDHDQ86WU2 507 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 NYXQ9GZU5 481 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 NBPF26B4DH59 902 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 GRIPAP1Q4V328 841 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 NBPF15Q8N660 670 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 KDM3BQ7LBC6 1761 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.72□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa14.72□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.72□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 DCTN1Q14203 1278 aa14.71□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LMO3-214ENST00000536509 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms