RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536405.5

DKFZP434K028-202, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene DKFZP434K028, Length 2,466 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKFZP434K028-202ENST00000536405 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
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DKFZP434K028-202ENST00000536405 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.8■□□□□ 0.92
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DKFZP434K028-202ENST00000536405 ERBB4Q15303 1308 aa20.8■□□□□ 0.92
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DKFZP434K028-202ENST00000536405 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.79■□□□□ 0.92
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DKFZP434K028-202ENST00000536405 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
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DKFZP434K028-202ENST00000536405 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
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DKFZP434K028-202ENST00000536405 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
DKFZP434K028-202ENST00000536405 NHSL1Q5SYE7 1610 aa20.73■□□□□ 0.91
DKFZP434K028-202ENST00000536405 SHANK3Q9BYB0 1731 aa20.73■□□□□ 0.91
DKFZP434K028-202ENST00000536405 A0A087WZG4 1122 aa20.72■□□□□ 0.91
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
DKFZP434K028-202ENST00000536405 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.72■□□□□ 0.91
DKFZP434K028-202ENST00000536405 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20.72■□□□□ 0.91
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.72■□□□□ 0.91
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