RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533249.5

PKP3-210, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 1,111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-210ENST00000533249 CACNA1SQ13698 1873 aa30.38■■■□□ 2.45
PKP3-210ENST00000533249 SMC1BQ8NDV3 1235 aa30.37■■■□□ 2.45
PKP3-210ENST00000533249 ZNF652Q9Y2D9 606 aa30.37■■■□□ 2.45
PKP3-210ENST00000533249 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
PKP3-210ENST00000533249 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
PKP3-210ENST00000533249 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
PKP3-210ENST00000533249 MIS18AQ9NYP9 233 aa30.36■■■□□ 2.45
PKP3-210ENST00000533249 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa30.36■■■□□ 2.45
PKP3-210ENST00000533249 NBPF26B4DH59 902 aa30.35■■■□□ 2.45
PKP3-210ENST00000533249 SRGNP10124 158 aa30.35■■■□□ 2.45
PKP3-210ENST00000533249 STYK1Q6J9G0 422 aa30.35■■■□□ 2.45
PKP3-210ENST00000533249 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
PKP3-210ENST00000533249 CLEC4GQ6UXB4 293 aa30.35■■■□□ 2.45
PKP3-210ENST00000533249 NBPF15Q8N660 670 aa30.35■■■□□ 2.45
PKP3-210ENST00000533249 CNKSR1Q969H4 720 aa30.35■■■□□ 2.45
PKP3-210ENST00000533249 SLX4Q8IY92 1834 aa30.35■■■□□ 2.45
PKP3-210ENST00000533249 NEFMP07197 916 aa30.34■■■□□ 2.45
PKP3-210ENST00000533249 ERFEQ4G0M1 354 aa30.33■■■□□ 2.45
PKP3-210ENST00000533249 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
PKP3-210ENST00000533249 MASTLQ96GX5 879 aa30.33■■■□□ 2.45
PKP3-210ENST00000533249 DPY19L2Q6NUT2 758 aa30.32■■■□□ 2.44
PKP3-210ENST00000533249 DLG5Q8TDM6 1919 aa30.32■■■□□ 2.44
PKP3-210ENST00000533249 TAOK3Q9H2K8 898 aa30.31■■■□□ 2.44
PKP3-210ENST00000533249 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP30.31■■■□□ 2.44
PKP3-210ENST00000533249 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
PKP3-210ENST00000533249 FAM177BA6PVY3 158 aa30.3■■■□□ 2.44
PKP3-210ENST00000533249 KLRG1Q96E93 195 aa30.3■■■□□ 2.44
PKP3-210ENST00000533249 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa30.29■■■□□ 2.44
PKP3-210ENST00000533249 LAMB4A4D0S4 1761 aa30.28■■■□□ 2.44
PKP3-210ENST00000533249 LTBP3Q9NS15 1303 aa30.28■■■□□ 2.44
PKP3-210ENST00000533249 TPTE2Q6XPS3 522 aa30.27■■■□□ 2.44
PKP3-210ENST00000533249 POTECB2RU33 542 aa30.26■■■□□ 2.43
PKP3-210ENST00000533249 HLFQ16534 295 aa30.26■■■□□ 2.43
PKP3-210ENST00000533249 SOGA3Q5TF21 947 aa30.26■■■□□ 2.43
PKP3-210ENST00000533249 NGEFQ8N5V2 710 aa30.26■■■□□ 2.43
PKP3-210ENST00000533249 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
PKP3-210ENST00000533249 KDM3BQ7LBC6 1761 aa30.26■■■□□ 2.43
PKP3-210ENST00000533249 NPR1P16066 1061 aa30.25■■■□□ 2.43
PKP3-210ENST00000533249 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
PKP3-210ENST00000533249 PLEKHF1Q96S99 279 aa30.25■■■□□ 2.43
PKP3-210ENST00000533249 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
PKP3-210ENST00000533249 RGL2O15211 777 aa30.24■■■□□ 2.43
PKP3-210ENST00000533249 NFE2L2Q16236 605 aa30.24■■■□□ 2.43
PKP3-210ENST00000533249 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
PKP3-210ENST00000533249 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
PKP3-210ENST00000533249 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
PKP3-210ENST00000533249 CCDC93Q567U6 631 aa30.21■■■□□ 2.43
PKP3-210ENST00000533249 C7orf43Q8WVR3 580 aa30.21■■■□□ 2.43
PKP3-210ENST00000533249 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
PKP3-210ENST00000533249 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa30.21■■■□□ 2.43
PKP3-210ENST00000533249 DDNO94850 711 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
PKP3-210ENST00000533249 JMYQ8N9B5 988 aa30.2■■■□□ 2.43
PKP3-210ENST00000533249 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
PKP3-210ENST00000533249 MYL6BP14649 208 aa30.17■■■□□ 2.42
PKP3-210ENST00000533249 OLFM4Q6UX06 510 aa30.17■■■□□ 2.42
PKP3-210ENST00000533249 KIF6Q6ZMV9 814 aa30.16■■■□□ 2.42
PKP3-210ENST00000533249 TTLL7Q6ZT98 887 aa30.16■■■□□ 2.42
PKP3-210ENST00000533249 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa30.16■■■□□ 2.42
PKP3-210ENST00000533249 NUP98P52948 1817 aa30.15■■■□□ 2.42
PKP3-210ENST00000533249 ERVV-1B6SEH8 477 aa30.15■■■□□ 2.42
PKP3-210ENST00000533249 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP30.15■■■□□ 2.42
PKP3-210ENST00000533249 NUTM1Q86Y26 1132 aa30.15■■■□□ 2.42
PKP3-210ENST00000533249 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
PKP3-210ENST00000533249 ABCC12Q96J65 1359 aa30.14■■■□□ 2.41
PKP3-210ENST00000533249 ALDH1B1P30837 517 aa30.13■■■□□ 2.41
PKP3-210ENST00000533249 NYXQ9GZU5 481 aa30.13■■■□□ 2.41
PKP3-210ENST00000533249 ZBTB3Q9H5J0 574 aa30.13■■■□□ 2.41
PKP3-210ENST00000533249 POTEIP0CG38 1075 aa30.12■■■□□ 2.41
PKP3-210ENST00000533249 POTEJP0CG39 1038 aa30.12■■■□□ 2.41
PKP3-210ENST00000533249 GPTP24298 496 aa30.12■■■□□ 2.41
PKP3-210ENST00000533249 CHADLQ6NUI6 762 aa30.11■■■□□ 2.41
PKP3-210ENST00000533249 RTKN2Q8IZC4 609 aa30.11■■■□□ 2.41
PKP3-210ENST00000533249 TSPYL4Q9UJ04 414 aa30.1■■■□□ 2.41
PKP3-210ENST00000533249 UBN2Q6ZU65 1347 aa30.08■■■□□ 2.41
PKP3-210ENST00000533249 ZNF541Q9H0D2 1346 aa30.08■■■□□ 2.41
PKP3-210ENST00000533249 IQCA1LA6NCM1 817 aa30.08■■■□□ 2.41
PKP3-210ENST00000533249 RIPK4P57078 832 aa30.07■■■□□ 2.4
PKP3-210ENST00000533249 CRY2Q49AN0 593 aa30.07■■■□□ 2.4
PKP3-210ENST00000533249 SYNE4Q8N205 404 aa30.07■■■□□ 2.4
PKP3-210ENST00000533249 SUSD4Q5VX71 490 aa30.06■■■□□ 2.4
PKP3-210ENST00000533249 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
PKP3-210ENST00000533249 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
PKP3-210ENST00000533249 ERBB4Q15303 1308 aa30.05■■■□□ 2.4
PKP3-210ENST00000533249 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
PKP3-210ENST00000533249 IARSP41252 1262 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
PKP3-210ENST00000533249 RALBP1Q15311 655 aa30.05■■■□□ 2.4
PKP3-210ENST00000533249 SCN4AP35499 1836 aa30.05■■■□□ 2.4
PKP3-210ENST00000533249 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
PKP3-210ENST00000533249 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
PKP3-210ENST00000533249 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
PKP3-210ENST00000533249 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
PKP3-210ENST00000533249 ZNF34Q8IZ26 560 aa30.03■■■□□ 2.4
PKP3-210ENST00000533249 RIC1Q4ADV7 1423 aa30.02■■■□□ 2.4
PKP3-210ENST00000533249 NTSR2O95665 410 aa30.01■■■□□ 2.39
PKP3-210ENST00000533249 TMPOP42166 694 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
PKP3-210ENST00000533249 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
PKP3-210ENST00000533249 LDHDQ86WU2 507 aa30.01■■■□□ 2.39
PKP3-210ENST00000533249 SNED1Q8TER0 1413 aa30■■■□□ 2.39
PKP3-210ENST00000533249 ANXA1P04083 346 aa30■■■□□ 2.39
PKP3-210ENST00000533249 PSMD1Q99460 953 aa30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.9 ms