RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530405.5

PACSIN3-206, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-206ENST00000530405 NPHP1O15259 732 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-206ENST00000530405 CAMTA2O94983 1202 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-206ENST00000530405 AIDAQ96BJ3 306 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-206ENST00000530405 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-206ENST00000530405 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-206ENST00000530405 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-206ENST00000530405 VEGFBP49765 207 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-206ENST00000530405 TEFQ10587 303 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-206ENST00000530405 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-206ENST00000530405 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-206ENST00000530405 BCORQ6W2J9 1755 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-206ENST00000530405 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.1■■□□□ 1.13
PACSIN3-206ENST00000530405 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-206ENST00000530405 IL17REQ8NFR9 667 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-206ENST00000530405 WBP1LQ9NX94 342 aa22.09■■□□□ 1.13
PACSIN3-206ENST00000530405 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-206ENST00000530405 A1BGP04217 495 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-206ENST00000530405 CCDC93Q567U6 631 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-206ENST00000530405 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.08■■□□□ 1.13
PACSIN3-206ENST00000530405 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.07■■□□□ 1.12
PACSIN3-206ENST00000530405 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-206ENST00000530405 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-206ENST00000530405 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-206ENST00000530405 HACL1Q9UJ83 578 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-206ENST00000530405 NPR1P16066 1061 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-206ENST00000530405 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-206ENST00000530405 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-206ENST00000530405 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-206ENST00000530405 RASSF10A6NK89 507 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-206ENST00000530405 LBX1P52954 281 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-206ENST00000530405 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-206ENST00000530405 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-206ENST00000530405 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-206ENST00000530405 EPHX2P34913 555 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-206ENST00000530405 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-206ENST00000530405 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-206ENST00000530405 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-206ENST00000530405 SLC34A2O95436 690 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-206ENST00000530405 CNTROBQ8N137 903 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-206ENST00000530405 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-206ENST00000530405 FZD9O00144 591 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-206ENST00000530405 RGL2O15211 777 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-206ENST00000530405 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PACSIN3-206ENST00000530405 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PACSIN3-206ENST00000530405 USP16Q9Y5T5 823 aa22■■□□□ 1.11
PACSIN3-206ENST00000530405 BTBD11A6QL63 1104 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-206ENST00000530405 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-206ENST00000530405 KCNQ3O43525 872 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-206ENST00000530405 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-206ENST00000530405 ABHD8Q96I13 439 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-206ENST00000530405 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.99■■□□□ 1.11
PACSIN3-206ENST00000530405 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-206ENST00000530405 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-206ENST00000530405 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-206ENST00000530405 GPC2Q8N158 579 aa21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-206ENST00000530405 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PACSIN3-206ENST00000530405 ALDH1B1P30837 517 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-206ENST00000530405 OLFM4Q6UX06 510 aa21.97■■□□□ 1.11
PACSIN3-206ENST00000530405 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-206ENST00000530405 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PACSIN3-206ENST00000530405 SYNE4Q8N205 404 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-206ENST00000530405 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-206ENST00000530405 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-206ENST00000530405 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.95■■□□□ 1.1
PACSIN3-206ENST00000530405 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-206ENST00000530405 PSMD1Q99460 953 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-206ENST00000530405 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-206ENST00000530405 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-206ENST00000530405 FAM161AQ3B820 660 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-206ENST00000530405 SNED1Q8TER0 1413 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-206ENST00000530405 JDP2Q8WYK2 163 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-206ENST00000530405 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-206ENST00000530405 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-206ENST00000530405 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-206ENST00000530405 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-206ENST00000530405 NBPF26B4DH59 902 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-206ENST00000530405 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-206ENST00000530405 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-206ENST00000530405 NBPF15Q8N660 670 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-206ENST00000530405 FAM177BA6PVY3 158 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-206ENST00000530405 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-206ENST00000530405 PRKAR2BP31323 418 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-206ENST00000530405 ECE1P42892 770 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-206ENST00000530405 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-206ENST00000530405 CRY2Q49AN0 593 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-206ENST00000530405 LTBP1Q14766 1721 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-206ENST00000530405 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-206ENST00000530405 CAPNS2Q96L46 248 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-206ENST00000530405 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-206ENST00000530405 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-206ENST00000530405 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3-206ENST00000530405 HLFQ16534 295 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-206ENST00000530405 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-206ENST00000530405 COL4A5P29400 1685 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-206ENST00000530405 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3-206ENST00000530405 RGS19P49795 217 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-206ENST00000530405 SCNN1DP51172 638 aa21.86■■□□□ 1.09
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