RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523213.1

ZBED8-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED8, Length 2,484 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8-202ENST00000523213 KIF1BPQ96EK5 621 aa18.06■□□□□ 0.48
ZBED8-202ENST00000523213 CHMLP26374 656 aa18.06■□□□□ 0.48
ZBED8-202ENST00000523213 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
ZBED8-202ENST00000523213 GLI3P10071 1580 aa18.05■□□□□ 0.48
ZBED8-202ENST00000523213 MTX1Q13505 466 aa18.05■□□□□ 0.48
ZBED8-202ENST00000523213 TTLL7Q6ZT98 887 aa18.05■□□□□ 0.48
ZBED8-202ENST00000523213 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa18.05■□□□□ 0.48
ZBED8-202ENST00000523213 NEXNQ0ZGT2 675 aa18.04■□□□□ 0.48
ZBED8-202ENST00000523213 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
ZBED8-202ENST00000523213 NHSL1Q5SYE7 1610 aa18.03■□□□□ 0.48
ZBED8-202ENST00000523213 UTYO14607 1347 aa18.03■□□□□ 0.48
ZBED8-202ENST00000523213 SASH1O94885 1247 aa18.03■□□□□ 0.48
ZBED8-202ENST00000523213 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa18.03■□□□□ 0.48
ZBED8-202ENST00000523213 PALD1Q9ULE6 856 aa18.03■□□□□ 0.48
ZBED8-202ENST00000523213 SHANK3Q9BYB0 1731 aa18.02■□□□□ 0.48
ZBED8-202ENST00000523213 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
ZBED8-202ENST00000523213 ANO2Q9NQ90 1003 aa18.02■□□□□ 0.48
ZBED8-202ENST00000523213 REC8O95072 547 aa18.01■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 DDIT3P35638 169 aa18.01■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 ZBTB3Q9H5J0 574 aa18.01■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 CHMP5Q9NZZ3 219 aa18.01■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 ASAP1Q9ULH1 1129 aa18.01■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 KAT6BQ8WYB5 2073 aa18.01■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 ERVV-2B6SEH9 535 aa18■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 AACSQ86V21 672 aa18■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 A0A087WZG4 1122 aa17.99■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 RABEP1Q15276 862 aa17.99■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 KCPQ6ZWJ8 1503 aa17.99■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 PIGBQ92521 554 aa17.98■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa17.98■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa17.98■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP17.97■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 PLBD2Q8NHP8 589 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 TMOD3Q9NYL9 352 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 ADAMTS2O95450 1211 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 GSE1Q14687 1217 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 AOX1Q06278 1338 aa17.96■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
ZBED8-202ENST00000523213 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa17.95■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 ARXQ96QS3 562 aa17.95■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 AK9Q5TCS8 1911 aa17.95■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 UBR2Q8IWV8 1755 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 MCM4P33991 863 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 CASP7P55210 303 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 DNAJC10Q8IXB1 793 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 ECHDC1Q9NTX5 307 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 LAMB4A4D0S4 1761 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 NEK4P51957 841 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 CHMP3Q9Y3E7 222 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 LMBR1LQ6UX01 489 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 ATG3Q9NT62 314 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 CNTROBQ8N137 903 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 HDAC5Q9UQL6 1122 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 TFCP2Q12800 502 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 PKP1Q13835 747 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 ERC1Q8IUD2 1116 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 BOLA2Q9H3K6 86 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 SSFA2P28290 1259 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 TTC41PQ6P2S7 1318 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 A0A0G2JS52 829 aa17.91■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 SGSM2O43147 1006 aa17.91■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 TNS2Q63HR2 1409 aa17.91■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 FOXO4P98177 505 aa17.91■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 SLC4A9Q96Q91 983 aa17.91■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 PAPPAQ13219 1627 aa17.91■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 PIP4K2BP78356 416 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 CHGBP05060 677 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
ZBED8-202ENST00000523213 H7C1W4 665 aa17.89■□□□□ 0.45
ZBED8-202ENST00000523213 ST18O60284 1047 aa17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms