RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-223	ENST00000515011	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PDE4D-223	ENST00000515011	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
PDE4D-223	ENST00000515011	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.08
PDE4D-223	ENST00000515011	RABEP1	Q15276	862 aa		28.01	■■■□□ 2.08
PDE4D-223	ENST00000515011	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.08
PDE4D-223	ENST00000515011	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		28	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		28	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		28	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	CHML	P26374	656 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	RILPL2	Q969X0	211 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	BTG4	Q9NY30	223 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	COL15A1	P39059	1388 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	DDIT3	P35638	169 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	NBPF26	B4DH59	902 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	NBPF14	Q5TI25	921 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	NBPF15	Q8N660	670 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	DISP2	A7MBM2	1401 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PDE4D-223	ENST00000515011	AK9	Q5TCS8	1911 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PDE4D-223	ENST00000515011	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PDE4D-223	ENST00000515011	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PDE4D-223	ENST00000515011	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PDE4D-223	ENST00000515011	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PDE4D-223	ENST00000515011	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PDE4D-223	ENST00000515011	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PDE4D-223	ENST00000515011	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	27.9	■■■□□ 2.06
PDE4D-223	ENST00000515011	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PDE4D-223	ENST00000515011	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PDE4D-223	ENST00000515011	CNTROB	Q8N137	903 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PDE4D-223	ENST00000515011	SASH1	O94885	1247 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PDE4D-223	ENST00000515011	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	GPATCH3	Q96I76	525 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	A1BG	P04217	495 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	CASP7	P55210	303 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	LRP6	O75581	1613 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011		A0A087WZG4	1122 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	MCC	P23508	829 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	AACS	Q86V21	672 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	TJP1	Q07157	1748 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	COPRS	Q9NQ92	184 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	ITGB4	P16144	1822 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	ST18	O60284	1047 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	ANAPC15	P60006	121 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	IL17RA	Q96F46	866 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	PIGB	Q92521	554 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PDE4D-223	ENST00000515011	SIL1	Q9H173	461 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PDE4D-223	ENST00000515011	IL25	Q9H293	177 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PDE4D-223	ENST00000515011		H7C1W4	665 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PDE4D-223	ENST00000515011	SGSM2	O43147	1006 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PDE4D-223	ENST00000515011	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PDE4D-223	ENST00000515011	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
PDE4D-223	ENST00000515011	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
PDE4D-223	ENST00000515011	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PDE4D-223	ENST00000515011	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PDE4D-223	ENST00000515011	GSE1	Q14687	1217 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PDE4D-223	ENST00000515011	PHLPP1	O60346	1717 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PDE4D-223	ENST00000515011	MCM4	P33991	863 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PDE4D-223	ENST00000515011	ATG3	Q9NT62	314 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PDE4D-223	ENST00000515011	BCL9	O00512	1426 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PDE4D-223	ENST00000515011	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PDE4D-223	ENST00000515011	PALD1	Q9ULE6	856 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PDE4D-223	ENST00000515011	NRAP	Q86VF7	1730 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PDE4D-223	ENST00000515011	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PDE4D-223	ENST00000515011	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PDE4D-223	ENST00000515011	EVI5L	Q96CN4	794 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PDE4D-223	ENST00000515011	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PDE4D-223	ENST00000515011	RAD50	Q92878	1312 aa		27.76	■■■□□ 2.04
PDE4D-223	ENST00000515011	FOXO4	P98177	505 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PDE4D-223	ENST00000515011	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03

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