RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512673.1

ALYREF-204, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 2

Gene ALYREF, Length 441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
ALYREF-204ENST00000512673 SCN11AQ9UI33 1791 aa21.52■■□□□ 1.04
ALYREF-204ENST00000512673 DGKZQ13574 1117 aa21.52■■□□□ 1.04
ALYREF-204ENST00000512673 OLFM4Q6UX06 510 aa21.52■■□□□ 1.04
ALYREF-204ENST00000512673 SLC24A1O60721 1099 aa21.51■■□□□ 1.03
ALYREF-204ENST00000512673 CNKSR1Q969H4 720 aa21.51■■□□□ 1.03
ALYREF-204ENST00000512673 ECE1P42892 770 aa21.5■■□□□ 1.03
ALYREF-204ENST00000512673 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
ALYREF-204ENST00000512673 LGR6Q9HBX8 967 aa21.5■■□□□ 1.03
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
ALYREF-204ENST00000512673 SOX10P56693 466 aa21.49■■□□□ 1.03
ALYREF-204ENST00000512673 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.49■■□□□ 1.03
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ALYREF-204ENST00000512673 NPHP1O15259 732 aa21.48■■□□□ 1.03
ALYREF-204ENST00000512673 SRGNP10124 158 aa21.48■■□□□ 1.03
ALYREF-204ENST00000512673 STYK1Q6J9G0 422 aa21.48■■□□□ 1.03
ALYREF-204ENST00000512673 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.48■■□□□ 1.03
ALYREF-204ENST00000512673 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.48■■□□□ 1.03
ALYREF-204ENST00000512673 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.48■■□□□ 1.03
ALYREF-204ENST00000512673 SOGA3Q5TF21 947 aa21.47■■□□□ 1.03
ALYREF-204ENST00000512673 CCDC93Q567U6 631 aa21.46■■□□□ 1.03
ALYREF-204ENST00000512673 CST9Q5W186 159 aa21.46■■□□□ 1.03
ALYREF-204ENST00000512673 CNBD1Q8NA66 436 aa21.46■■□□□ 1.03
ALYREF-204ENST00000512673 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.46■■□□□ 1.03
ALYREF-204ENST00000512673 SCN7AQ01118 1682 aa21.45■■□□□ 1.02
ALYREF-204ENST00000512673 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
ALYREF-204ENST00000512673 MASTLQ96GX5 879 aa21.45■■□□□ 1.02
ALYREF-204ENST00000512673 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
ALYREF-204ENST00000512673 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.44■■□□□ 1.02
ALYREF-204ENST00000512673 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.44■■□□□ 1.02
ALYREF-204ENST00000512673 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.43■■□□□ 1.02
ALYREF-204ENST00000512673 ST5P78524 1137 aa21.42■■□□□ 1.02
ALYREF-204ENST00000512673 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.42■■□□□ 1.02
ALYREF-204ENST00000512673 A0A087WZG4 1122 aa21.41■■□□□ 1.02
ALYREF-204ENST00000512673 FZD9O00144 591 aa21.41■■□□□ 1.02
ALYREF-204ENST00000512673 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
ALYREF-204ENST00000512673 MAP2K2P36507 400 aa21.4■■□□□ 1.02
ALYREF-204ENST00000512673 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
ALYREF-204ENST00000512673 EPS15P42566 896 aa21.4■■□□□ 1.02
ALYREF-204ENST00000512673 CDCA8Q53HL2 280 aa21.4■■□□□ 1.02
ALYREF-204ENST00000512673 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
ALYREF-204ENST00000512673 GPC2Q8N158 579 aa21.4■■□□□ 1.02
ALYREF-204ENST00000512673 SETDB2Q96T68 719 aa21.4■■□□□ 1.02
ALYREF-204ENST00000512673 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-204ENST00000512673 CIAPIN1Q6FI81 312 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-204ENST00000512673 SYNE4Q8N205 404 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-204ENST00000512673 MRC1P22897 1456 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-204ENST00000512673 COL4A5P29400 1685 aa21.37■■□□□ 1.01
ALYREF-204ENST00000512673 CA12O43570 354 aa21.37■■□□□ 1.01
ALYREF-204ENST00000512673 STARD3NLO95772 234 aa21.37■■□□□ 1.01
ALYREF-204ENST00000512673 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
ALYREF-204ENST00000512673 ZIC5Q96T25 663 aa21.37■■□□□ 1.01
ALYREF-204ENST00000512673 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.36■■□□□ 1.01
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ALYREF-204ENST00000512673 JDP2Q8WYK2 163 aa21.33■■□□□ 1.01
ALYREF-204ENST00000512673 A1BGP04217 495 aa21.32■■□□□ 1
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ALYREF-204ENST00000512673 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.32■■□□□ 1
ALYREF-204ENST00000512673 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
ALYREF-204ENST00000512673 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.31■■□□□ 1
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
ALYREF-204ENST00000512673 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
ALYREF-204ENST00000512673 BCORQ6W2J9 1755 aa21.31■■□□□ 1
ALYREF-204ENST00000512673 FAM177BA6PVY3 158 aa21.3■■□□□ 1
ALYREF-204ENST00000512673 SLC51AQ86UW1 340 aa21.3■■□□□ 1
ALYREF-204ENST00000512673 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
ALYREF-204ENST00000512673 HMOX1P09601 288 aa21.28■■□□□ 1
ALYREF-204ENST00000512673 IL13P35225 146 aa21.28■■□□□ 1
ALYREF-204ENST00000512673 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
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ALYREF-204ENST00000512673 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.27■■□□□ 1
ALYREF-204ENST00000512673 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
ALYREF-204ENST00000512673 SNED1Q8TER0 1413 aa21.27■■□□□ 1
ALYREF-204ENST00000512673 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
ALYREF-204ENST00000512673 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
ALYREF-204ENST00000512673 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.25■□□□□ 0.99
ALYREF-204ENST00000512673 PSMD1Q99460 953 aa21.24■□□□□ 0.99
ALYREF-204ENST00000512673 DLK2Q6UY11 383 aa21.23■□□□□ 0.99
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF790Q6PG37 636 aa21.22■□□□□ 0.99
ALYREF-204ENST00000512673 HHIPL1Q96JK4 782 aa21.22■□□□□ 0.99
ALYREF-204ENST00000512673 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
ALYREF-204ENST00000512673 ALDH1B1P30837 517 aa21.21■□□□□ 0.99
ALYREF-204ENST00000512673 NOGQ13253 232 aa21.21■□□□□ 0.99
ALYREF-204ENST00000512673 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
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ALYREF-204ENST00000512673 MORC1Q86VD1 984 aa21.2■□□□□ 0.98
ALYREF-204ENST00000512673 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
ALYREF-204ENST00000512673 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.2■□□□□ 0.98
ALYREF-204ENST00000512673 KCNQ3O43525 872 aa21.19■□□□□ 0.98
ALYREF-204ENST00000512673 TRPA1O75762 1119 aa21.19■□□□□ 0.98
ALYREF-204ENST00000512673 HUNKP57058 714 aa21.19■□□□□ 0.98
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