RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-215ENST00000510074 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-215ENST00000510074 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-215ENST00000510074 BTBD11A6QL63 1104 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-215ENST00000510074 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-215ENST00000510074 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-215ENST00000510074 CNTNAP1P78357 1384 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-215ENST00000510074 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-215ENST00000510074 CCDC93Q567U6 631 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-215ENST00000510074 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SH3BP2-215ENST00000510074 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-215ENST00000510074 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-215ENST00000510074 PASKQ96RG2 1323 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP2-215ENST00000510074 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP2-215ENST00000510074 NPR1P16066 1061 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP2-215ENST00000510074 VEGFBP49765 207 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP2-215ENST00000510074 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP2-215ENST00000510074 HACL1Q9UJ83 578 aa21.31■■□□□ 1
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SH3BP2-215ENST00000510074 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP2-215ENST00000510074 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.3■■□□□ 12e-6■■■■□ 20.1
SH3BP2-215ENST00000510074 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP2-215ENST00000510074 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
SH3BP2-215ENST00000510074 USP16Q9Y5T5 823 aa21.3■■□□□ 1
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SH3BP2-215ENST00000510074 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP2-215ENST00000510074 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
SH3BP2-215ENST00000510074 KCNQ3O43525 872 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP2-215ENST00000510074 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
SH3BP2-215ENST00000510074 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
SH3BP2-215ENST00000510074 SLX4Q8IY92 1834 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP2-215ENST00000510074 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
SH3BP2-215ENST00000510074 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP2-215ENST00000510074 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
SH3BP2-215ENST00000510074 EPHX2P34913 555 aa21.27■■□□□ 1
SH3BP2-215ENST00000510074 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.27■■□□□ 1
SH3BP2-215ENST00000510074 FAM177BA6PVY3 158 aa21.26■□□□□ 0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 ALDH1B1P30837 517 aa21.26■□□□□ 0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 LBX1P52954 281 aa21.26■□□□□ 0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 CNTROBQ8N137 903 aa21.26■□□□□ 0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 WBP1LQ9NX94 342 aa21.26■□□□□ 0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.26■□□□□ 0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.25■□□□□ 0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 OLFM4Q6UX06 510 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 SYNE4Q8N205 404 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 SCN7AQ01118 1682 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.23■□□□□ 0.99
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SH3BP2-215ENST00000510074 JDP2Q8WYK2 163 aa21.23■□□□□ 0.99
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SH3BP2-215ENST00000510074 CFAP53Q96M91 514 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 SCN4AP35499 1836 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 FZD9O00144 591 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 GPC2Q8N158 579 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 RASSF10A6NK89 507 aa21.2■□□□□ 0.98
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SH3BP2-215ENST00000510074 RGL2O15211 777 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-215ENST00000510074 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-215ENST00000510074 MCM10Q7L590 875 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-215ENST00000510074 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-215ENST00000510074 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-215ENST00000510074 CACNA1SQ13698 1873 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-215ENST00000510074 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.18■□□□□ 0.98
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SH3BP2-215ENST00000510074 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP2-215ENST00000510074 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
SH3BP2-215ENST00000510074 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
SH3BP2-215ENST00000510074 NBPF15Q8N660 670 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP2-215ENST00000510074 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP2-215ENST00000510074 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
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SH3BP2-215ENST00000510074 NGEFQ8N5V2 710 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-215ENST00000510074 ABHD8Q96I13 439 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-215ENST00000510074 PSMD1Q99460 953 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-215ENST00000510074 NYXQ9GZU5 481 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-215ENST00000510074 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-215ENST00000510074 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP2-215ENST00000510074 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
SH3BP2-215ENST00000510074 ECE1P42892 770 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2-215ENST00000510074 GRM1Q13255 1194 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2-215ENST00000510074 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2-215ENST00000510074 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2-215ENST00000510074 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2-215ENST00000510074 DCTN1Q14203 1278 aa21.13■□□□□ 0.97
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