RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 MTX1Q13505 466 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP2-209ENST00000504450 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP2-209ENST00000504450 BARGINQ6ZT62 677 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP2-209ENST00000504450 DISP2A7MBM2 1401 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP2-209ENST00000504450 UTYO14607 1347 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP2-209ENST00000504450 LINS1Q8NG48 757 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP2-209ENST00000504450 FMNL2Q96PY5 1086 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP2-209ENST00000504450 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP2-209ENST00000504450 USP16Q9Y5T5 823 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP2-209ENST00000504450 C5P01031 1676 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP2-209ENST00000504450 RAB11FIP3O75154 756 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-209ENST00000504450 DDX58O95786 925 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-209ENST00000504450 NBPF14Q5TI25 921 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRCC1Q9C099 1032 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-209ENST00000504450 STAP2Q9UGK3 403 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-209ENST00000504450 SDSP20132 328 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-209ENST00000504450 PDE1AP54750 535 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-209ENST00000504450 BECN1Q14457 450 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-209ENST00000504450 TTC5Q8N0Z6 440 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-209ENST00000504450 APBB1O00213 710 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 IGKV5-2P06315 115 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 COPS6Q7L5N1 327 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 XAGE3Q8WTP9 111 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 TBC1D2Q9BYX2 928 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 HDAC5Q9UQL6 1122 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 ERBB4Q15303 1308 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 SHANK3Q9BYB0 1731 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 TNS2Q63HR2 1409 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 KAZALD1Q96I82 304 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 KIF2CQ99661 725 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 AOX1Q06278 1338 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 KCPQ6ZWJ8 1503 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 GRM8O00222 908 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 SRGAP3O43295 1099 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 NEURL1BA8MQ27 555 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 NBPF26B4DH59 902 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 SURF6O75683 361 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 MYL6BP14649 208 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 DDB1Q16531 1140 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 RIC3Q7Z5B4 369 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 NBPF15Q8N660 670 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 RHPN1Q8TCX5 695 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 SNX21Q969T3 373 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 SUCLG2Q96I99 432 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 PAPPAQ13219 1627 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 MX1P20591 662 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 GCKRQ14397 625 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 UBR2Q8IWV8 1755 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 LAMB4A4D0S4 1761 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 KIF1BPQ96EK5 621 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 USP26Q9BXU7 913 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 ANTXR1Q9H6X2 564 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 COL15A1P39059 1388 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 NUP188Q5SRE5 1749 aa13.27□□□□□ -0.28
SH3BP2-209ENST00000504450 NEXNQ0ZGT2 675 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 PTF1AQ7RTS3 328 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 PLBD2Q8NHP8 589 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 MYD88Q99836 296 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 SPON1Q9HCB6 807 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 RREB1Q92766 1687 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNQ2O43526 872 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 YY1P25490 414 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 DCAF8L1A6NGE4 600 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 CASP7P55210 303 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 NBR1Q14596 966 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 EPHA10Q5JZY3 1008 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 TSHZ3Q63HK5 1081 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 CASC1Q6TDU7 716 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 NUTM1Q86Y26 1132 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 ERC1Q8IUD2 1116 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 VSIG10Q8N0Z9 540 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 PI4K2BQ8TCG2 481 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 PIGBQ92521 554 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 BCL11AQ9H165 835 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 ATG3Q9NT62 314 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 TMOD3Q9NYL9 352 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-209ENST00000504450 H7C1W4 665 aa13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms