RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 GLTPD2A6NH11 291 aa29.99■■■□□ 2.39
TRDMT1-211ENST00000495022 NPHP1O15259 732 aa29.99■■■□□ 2.39
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC24Q8N4L8 307 aa29.99■■■□□ 2.39
TRDMT1-211ENST00000495022 RGL2O15211 777 aa29.98■■■□□ 2.39
TRDMT1-211ENST00000495022 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
TRDMT1-211ENST00000495022 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
TRDMT1-211ENST00000495022 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa29.98■■■□□ 2.39
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF652Q9Y2D9 606 aa29.98■■■□□ 2.39
TRDMT1-211ENST00000495022 NEFMP07197 916 aa29.96■■■□□ 2.39
TRDMT1-211ENST00000495022 STYK1Q6J9G0 422 aa29.96■■■□□ 2.39
TRDMT1-211ENST00000495022 CNKSR1Q969H4 720 aa29.96■■■□□ 2.39
TRDMT1-211ENST00000495022 C21orf2O43822 256 aa29.95■■■□□ 2.39
TRDMT1-211ENST00000495022 SRGNP10124 158 aa29.94■■■□□ 2.38
TRDMT1-211ENST00000495022 LTBP3Q9NS15 1303 aa29.94■■■□□ 2.38
TRDMT1-211ENST00000495022 NBPF26B4DH59 902 aa29.93■■■□□ 2.38
TRDMT1-211ENST00000495022 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
TRDMT1-211ENST00000495022 IFFO2Q5TF58 517 aa29.93■■■□□ 2.38
TRDMT1-211ENST00000495022 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
TRDMT1-211ENST00000495022 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
TRDMT1-211ENST00000495022 NBPF15Q8N660 670 aa29.93■■■□□ 2.38
TRDMT1-211ENST00000495022 SMC1BQ8NDV3 1235 aa29.93■■■□□ 2.38
TRDMT1-211ENST00000495022 NUP98P52948 1817 aa29.93■■■□□ 2.38
TRDMT1-211ENST00000495022 MASTLQ96GX5 879 aa29.92■■■□□ 2.38
TRDMT1-211ENST00000495022 PCNTO95613 3336 aa29.91■■■□□ 2.38
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
TRDMT1-211ENST00000495022 SOGA3Q5TF21 947 aa29.9■■■□□ 2.38
TRDMT1-211ENST00000495022 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
TRDMT1-211ENST00000495022 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
TRDMT1-211ENST00000495022 PLEKHF1Q96S99 279 aa29.9■■■□□ 2.38
TRDMT1-211ENST00000495022 TAOK3Q9H2K8 898 aa29.9■■■□□ 2.38
TRDMT1-211ENST00000495022 DPY19L2Q6NUT2 758 aa29.89■■■□□ 2.37
TRDMT1-211ENST00000495022 MIS18AQ9NYP9 233 aa29.89■■■□□ 2.37
TRDMT1-211ENST00000495022 ERFEQ4G0M1 354 aa29.88■■■□□ 2.37
TRDMT1-211ENST00000495022 TPTE2Q6XPS3 522 aa29.88■■■□□ 2.37
TRDMT1-211ENST00000495022 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP29.88■■■□□ 2.37
TRDMT1-211ENST00000495022 NFE2L2Q16236 605 aa29.87■■■□□ 2.37
TRDMT1-211ENST00000495022 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
TRDMT1-211ENST00000495022 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
TRDMT1-211ENST00000495022 NPR1P16066 1061 aa29.85■■■□□ 2.37
TRDMT1-211ENST00000495022 KLRG1Q96E93 195 aa29.85■■■□□ 2.37
TRDMT1-211ENST00000495022 HTRA3P83110 453 aa29.83■■■□□ 2.37
TRDMT1-211ENST00000495022 POTECB2RU33 542 aa29.82■■■□□ 2.36
TRDMT1-211ENST00000495022 HLFQ16534 295 aa29.82■■■□□ 2.36
TRDMT1-211ENST00000495022 C7orf43Q8WVR3 580 aa29.82■■■□□ 2.36
TRDMT1-211ENST00000495022 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.82■■■□□ 2.36
TRDMT1-211ENST00000495022 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC93Q567U6 631 aa29.8■■■□□ 2.36
TRDMT1-211ENST00000495022 ERVV-1B6SEH8 477 aa29.79■■■□□ 2.36
TRDMT1-211ENST00000495022 SCN4AP35499 1836 aa29.79■■■□□ 2.36
TRDMT1-211ENST00000495022 JMYQ8N9B5 988 aa29.78■■■□□ 2.36
TRDMT1-211ENST00000495022 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
TRDMT1-211ENST00000495022 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa29.77■■■□□ 2.36
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM177BA6PVY3 158 aa29.77■■■□□ 2.36
TRDMT1-211ENST00000495022 NYXQ9GZU5 481 aa29.77■■■□□ 2.36
TRDMT1-211ENST00000495022 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
TRDMT1-211ENST00000495022 KIF6Q6ZMV9 814 aa29.76■■■□□ 2.35
TRDMT1-211ENST00000495022 NGEFQ8N5V2 710 aa29.75■■■□□ 2.35
TRDMT1-211ENST00000495022 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
TRDMT1-211ENST00000495022 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
TRDMT1-211ENST00000495022 ERBB4Q15303 1308 aa29.74■■■□□ 2.35
TRDMT1-211ENST00000495022 ALDH1B1P30837 517 aa29.74■■■□□ 2.35
TRDMT1-211ENST00000495022 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP29.74■■■□□ 2.35
TRDMT1-211ENST00000495022 RALBP1Q15311 655 aa29.74■■■□□ 2.35
TRDMT1-211ENST00000495022 RTKN2Q8IZC4 609 aa29.73■■■□□ 2.35
TRDMT1-211ENST00000495022 RIC1Q4ADV7 1423 aa29.73■■■□□ 2.35
TRDMT1-211ENST00000495022 DDNO94850 711 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
TRDMT1-211ENST00000495022 CRY2Q49AN0 593 aa29.72■■■□□ 2.35
TRDMT1-211ENST00000495022 TTLL7Q6ZT98 887 aa29.72■■■□□ 2.35
TRDMT1-211ENST00000495022 ABCC12Q96J65 1359 aa29.72■■■□□ 2.35
TRDMT1-211ENST00000495022 MYL6BP14649 208 aa29.71■■■□□ 2.35
TRDMT1-211ENST00000495022 TSPYL4Q9UJ04 414 aa29.7■■■□□ 2.35
TRDMT1-211ENST00000495022 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
TRDMT1-211ENST00000495022 IQCA1LA6NCM1 817 aa29.68■■■□□ 2.34
TRDMT1-211ENST00000495022 NUTM1Q86Y26 1132 aa29.68■■■□□ 2.34
TRDMT1-211ENST00000495022 BABAM1Q9NWV8 329 aa29.68■■■□□ 2.34
TRDMT1-211ENST00000495022 UBN2Q6ZU65 1347 aa29.68■■■□□ 2.34
TRDMT1-211ENST00000495022 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa29.67■■■□□ 2.34
TRDMT1-211ENST00000495022 RIPK4P57078 832 aa29.67■■■□□ 2.34
TRDMT1-211ENST00000495022 CHADLQ6NUI6 762 aa29.67■■■□□ 2.34
TRDMT1-211ENST00000495022 OLFM4Q6UX06 510 aa29.67■■■□□ 2.34
TRDMT1-211ENST00000495022 ZBTB3Q9H5J0 574 aa29.67■■■□□ 2.34
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
TRDMT1-211ENST00000495022 SNED1Q8TER0 1413 aa29.67■■■□□ 2.34
TRDMT1-211ENST00000495022 GPTP24298 496 aa29.65■■■□□ 2.34
TRDMT1-211ENST00000495022 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.65■■■□□ 2.34
TRDMT1-211ENST00000495022 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF34Q8IZ26 560 aa29.65■■■□□ 2.34
TRDMT1-211ENST00000495022 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.33
TRDMT1-211ENST00000495022 TMPOP42166 694 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.33
TRDMT1-211ENST00000495022 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa29.64■■■□□ 2.33
TRDMT1-211ENST00000495022 PSMD1Q99460 953 aa29.64■■■□□ 2.33
TRDMT1-211ENST00000495022 IARSP41252 1262 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
TRDMT1-211ENST00000495022 SUSD4Q5VX71 490 aa29.63■■■□□ 2.33
TRDMT1-211ENST00000495022 LRP10Q7Z4F1 713 aa29.63■■■□□ 2.33
TRDMT1-211ENST00000495022 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF541Q9H0D2 1346 aa29.62■■■□□ 2.33
TRDMT1-211ENST00000495022 POTEIP0CG38 1075 aa29.62■■■□□ 2.33
TRDMT1-211ENST00000495022 POTEJP0CG39 1038 aa29.62■■■□□ 2.33
TRDMT1-211ENST00000495022 SYNE4Q8N205 404 aa29.62■■■□□ 2.33
TRDMT1-211ENST00000495022 NTSR2O95665 410 aa29.61■■■□□ 2.33
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