RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 TMOD3Q9NYL9 352 aa12.96□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 UTRNP46939 3433 aa12.95□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 ERBB4Q15303 1308 aa12.95□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 ALDH1L1O75891 902 aa12.95□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 ANKRD45Q5TZF3 282 aa12.95□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 USP44Q9H0E7 712 aa12.95□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa12.95□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 TXNRD1Q16881 649 aa12.94□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 LNPKQ9C0E8 428 aa12.94□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 USP16Q9Y5T5 823 aa12.94□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 MYL6BP14649 208 aa12.93□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 XAGE3Q8WTP9 111 aa12.93□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 ITGB4P16144 1822 aa12.92□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP8B2P98198 1209 aa12.92□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 COL24A1Q17RW2 1714 aa12.92□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 NBPF14Q5TI25 921 aa12.92□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 LRP10Q7Z4F1 713 aa12.92□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 LINS1Q8NG48 757 aa12.92□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 HDAC5Q9UQL6 1122 aa12.92□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 COPS6Q7L5N1 327 aa12.91□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 RIC3Q7Z5B4 369 aa12.91□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 PIGBQ92521 554 aa12.91□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 NEXNQ0ZGT2 675 aa12.9□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 LRRC4BQ9NT99 713 aa12.9□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 TAF1LQ8IZX4 1826 aa12.9□□□□□ -0.34
GTPBP1-211ENST00000487538 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa12.89□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 VSIG10Q8N0Z9 540 aa12.89□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 ATG3Q9NT62 314 aa12.89□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa12.88□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 NBPF26B4DH59 902 aa12.88□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 GRM8O00222 908 aa12.88□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC15A2Q16348 729 aa12.88□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF827Q17R98 1081 aa12.88□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 NBPF15Q8N660 670 aa12.88□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 SSH3Q8TE77 659 aa12.88□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 ASAP1Q9ULH1 1129 aa12.88□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 UTYO14607 1347 aa12.88□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa12.87□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 POLA2Q14181 598 aa12.87□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 BMP2KLQ5H9B9 411 aa12.87□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 PLBD2Q8NHP8 589 aa12.87□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 NEURL1BA8MQ27 555 aa12.86□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 IGKV5-2P06315 115 aa12.86□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 MTX1Q13505 466 aa12.86□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa12.86□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 MYD88Q99836 296 aa12.86□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa12.86□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 APBB1O00213 710 aa12.85□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 SRGAP3O43295 1099 aa12.85□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 STARD3NLO95772 234 aa12.85□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 A1BGP04217 495 aa12.85□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 GCKRQ14397 625 aa12.85□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC27A3Q5K4L6 730 aa12.85□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa12.85□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 DNAJC10Q8IXB1 793 aa12.85□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 AKT1S1Q96B36 256 aa12.85□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 LRRCC1Q9C099 1032 aa12.85□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 STK32BQ9NY57 414 aa12.85□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 C4BP0C0L5 1744 aa12.85□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 RAB11FIP3O75154 756 aa12.84□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 PTGER2P43116 358 aa12.84□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 SPON1Q9HCB6 807 aa12.84□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF831Q5JPB2 1677 aa12.83□□□□□ -0.35
GTPBP1-211ENST00000487538 PALLDQ8WX93 1383 aa12.83□□□□□ -0.36
GTPBP1-211ENST00000487538 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa12.83□□□□□ -0.36
GTPBP1-211ENST00000487538 SUCLG2Q96I99 432 aa12.83□□□□□ -0.36
GTPBP1-211ENST00000487538 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
GTPBP1-211ENST00000487538 SGIP1Q9BQI5 828 aa12.83□□□□□ -0.36
GTPBP1-211ENST00000487538 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
GTPBP1-211ENST00000487538 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
GTPBP1-211ENST00000487538 COL15A1P39059 1388 aa12.82□□□□□ -0.36
GTPBP1-211ENST00000487538 SURF6O75683 361 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
GTPBP1-211ENST00000487538 ZBTB7AO95365 584 aa12.82□□□□□ -0.36
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNQ4P56696 695 aa12.82□□□□□ -0.36
GTPBP1-211ENST00000487538 TTC22Q5TAA0 569 aa12.82□□□□□ -0.36
GTPBP1-211ENST00000487538 TTLL7Q6ZT98 887 aa12.82□□□□□ -0.36
GTPBP1-211ENST00000487538 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
GTPBP1-211ENST00000487538 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
GTPBP1-211ENST00000487538 UBR3Q6ZT12 1888 aa12.82□□□□□ -0.36
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