RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484986.1

PTPRN-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, human

TSL 4

Gene PTPRN, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRN-215	ENST00000484986	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	29.37	■■■□□ 2.29
PTPRN-215	ENST00000484986	SOGA3	Q5TF21	947 aa		29.36	■■■□□ 2.29
PTPRN-215	ENST00000484986	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		29.36	■■■□□ 2.29
PTPRN-215	ENST00000484986	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	29.36	■■■□□ 2.29
PTPRN-215	ENST00000484986	SRGN	P10124	158 aa		29.35	■■■□□ 2.29
PTPRN-215	ENST00000484986	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	29.35	■■■□□ 2.29
PTPRN-215	ENST00000484986	MASTL	Q96GX5	879 aa		29.35	■■■□□ 2.29
PTPRN-215	ENST00000484986	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	29.34	■■■□□ 2.29
PTPRN-215	ENST00000484986	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		29.34	■■■□□ 2.29
PTPRN-215	ENST00000484986	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		29.33	■■■□□ 2.29
PTPRN-215	ENST00000484986	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	29.33	■■■□□ 2.29
PTPRN-215	ENST00000484986	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		29.33	■■■□□ 2.29
PTPRN-215	ENST00000484986	NBPF26	B4DH59	902 aa		29.32	■■■□□ 2.28
PTPRN-215	ENST00000484986	ERFE	Q4G0M1	354 aa		29.32	■■■□□ 2.28
PTPRN-215	ENST00000484986	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	29.32	■■■□□ 2.28
PTPRN-215	ENST00000484986	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	29.32	■■■□□ 2.28
PTPRN-215	ENST00000484986	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		29.32	■■■□□ 2.28
PTPRN-215	ENST00000484986	NBPF15	Q8N660	670 aa		29.32	■■■□□ 2.28
PTPRN-215	ENST00000484986	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		29.31	■■■□□ 2.28
PTPRN-215	ENST00000484986	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	29.31	■■■□□ 2.28
PTPRN-215	ENST00000484986	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PTPRN-215	ENST00000484986	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	29.28	■■■□□ 2.28
PTPRN-215	ENST00000484986	NPR1	P16066	1061 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PTPRN-215	ENST00000484986	NFE2L2	Q16236	605 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PTPRN-215	ENST00000484986	KLRG1	Q96E93	195 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PTPRN-215	ENST00000484986	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PTPRN-215	ENST00000484986	WDR90	Q96KV7	1748 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PTPRN-215	ENST00000484986	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	29.26	■■■□□ 2.27
PTPRN-215	ENST00000484986	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PTPRN-215	ENST00000484986	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PTPRN-215	ENST00000484986	HTRA3	P83110	453 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PTPRN-215	ENST00000484986	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	29.23	■■■□□ 2.27
PTPRN-215	ENST00000484986	CCDC93	Q567U6	631 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PTPRN-215	ENST00000484986	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PTPRN-215	ENST00000484986	HLF	Q16534	295 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PTPRN-215	ENST00000484986	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PTPRN-215	ENST00000484986	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PTPRN-215	ENST00000484986	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	29.21	■■■□□ 2.27
PTPRN-215	ENST00000484986	JMY	Q8N9B5	988 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PTPRN-215	ENST00000484986	NYX	Q9GZU5	481 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PTPRN-215	ENST00000484986	POTEC	B2RU33	542 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PTPRN-215	ENST00000484986	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PTPRN-215	ENST00000484986	SLX4	Q8IY92	1834 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PTPRN-215	ENST00000484986	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PTPRN-215	ENST00000484986	FAM177B	A6PVY3	158 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PTPRN-215	ENST00000484986	ALDH1B1	P30837	517 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PTPRN-215	ENST00000484986	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PTPRN-215	ENST00000484986	NGEF	Q8N5V2	710 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PTPRN-215	ENST00000484986	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PTPRN-215	ENST00000484986	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PTPRN-215	ENST00000484986	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	29.17	■■■□□ 2.26
PTPRN-215	ENST00000484986	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PTPRN-215	ENST00000484986	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PTPRN-215	ENST00000484986	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	29.16	■■■□□ 2.26
PTPRN-215	ENST00000484986	RALBP1	Q15311	655 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PTPRN-215	ENST00000484986	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
PTPRN-215	ENST00000484986	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
PTPRN-215	ENST00000484986	ERBB4	Q15303	1308 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PTPRN-215	ENST00000484986	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PTPRN-215	ENST00000484986	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PTPRN-215	ENST00000484986	MYL6B	P14649	208 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PTPRN-215	ENST00000484986	CRY2	Q49AN0	593 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PTPRN-215	ENST00000484986	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PTPRN-215	ENST00000484986	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PTPRN-215	ENST00000484986	CHADL	Q6NUI6	762 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PTPRN-215	ENST00000484986	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PTPRN-215	ENST00000484986	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PTPRN-215	ENST00000484986	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
PTPRN-215	ENST00000484986	RIPK4	P57078	832 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PTPRN-215	ENST00000484986	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PTPRN-215	ENST00000484986	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
PTPRN-215	ENST00000484986	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PTPRN-215	ENST00000484986	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
PTPRN-215	ENST00000484986	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PTPRN-215	ENST00000484986	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PTPRN-215	ENST00000484986	CACNA1S	Q13698	1873 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PTPRN-215	ENST00000484986	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
PTPRN-215	ENST00000484986	GPT	P24298	496 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PTPRN-215	ENST00000484986	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PTPRN-215	ENST00000484986	ABCC12	Q96J65	1359 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PTPRN-215	ENST00000484986	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
PTPRN-215	ENST00000484986	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
PTPRN-215	ENST00000484986	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PTPRN-215	ENST00000484986	OLFM4	Q6UX06	510 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PTPRN-215	ENST00000484986	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
PTPRN-215	ENST00000484986	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PTPRN-215	ENST00000484986	PSMD1	Q99460	953 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PTPRN-215	ENST00000484986	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PTPRN-215	ENST00000484986	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PTPRN-215	ENST00000484986	LDHD	Q86WU2	507 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PTPRN-215	ENST00000484986	SYNE4	Q8N205	404 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PTPRN-215	ENST00000484986	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
PTPRN-215	ENST00000484986	PARP10	Q53GL7	1025 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PTPRN-215	ENST00000484986	SUSD4	Q5VX71	490 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PTPRN-215	ENST00000484986	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
PTPRN-215	ENST00000484986	CREBZF	Q9NS37	354 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PTPRN-215	ENST00000484986	PCNT	O95613	3336 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PTPRN-215	ENST00000484986	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
PTPRN-215	ENST00000484986	JDP2	Q8WYK2	163 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PTPRN-215	ENST00000484986	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24

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