RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ATG4B-217ENST00000475693 USP44Q9H0E7 712 aa22.8■■□□□ 1.24
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ATG4B-217ENST00000475693 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.79■■□□□ 1.24
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ATG4B-217ENST00000475693 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
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ATG4B-217ENST00000475693 APBA3O96018 575 aa22.74■■□□□ 1.23
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ATG4B-217ENST00000475693 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.71■■□□□ 1.23
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ATG4B-217ENST00000475693 BCL11AQ9H165 835 aa22.69■■□□□ 1.22
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ATG4B-217ENST00000475693 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.59■■□□□ 1.21
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ATG4B-217ENST00000475693 ZNF827Q17R98 1081 aa22.59■■□□□ 1.21
ATG4B-217ENST00000475693 NLRP10Q86W26 655 aa22.59■■□□□ 1.21
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