RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460567.5

SUCLG2-202, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SUCLG2, Length 1,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-202ENST00000460567 NUTM1Q86Y26 1132 aa19.02■□□□□ 0.64
SUCLG2-202ENST00000460567 TMEM94Q12767 1356 aa19.02■□□□□ 0.64
SUCLG2-202ENST00000460567 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
SUCLG2-202ENST00000460567 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 ERBB4Q15303 1308 aa19.01■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 TSHZ3Q63HK5 1081 aa19.01■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 EVI5LQ96CN4 794 aa19.01■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 NLRP2Q9NX02 1062 aa19.01■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP19■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 RIC3Q7Z5B4 369 aa19■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 PLEKHG5O94827 1062 aa18.99■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 MBD3O95983 291 aa18.99■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 TTC5Q8N0Z6 440 aa18.99■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa18.99■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF445P59923 1031 aa18.98■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 PDIA6Q15084 440 aa18.98■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 UNC5CLQ8IV45 518 aa18.98■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 KLHL34Q8N239 644 aa18.98■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 FMNL2Q96PY5 1086 aa18.98■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 TICAM2Q86XR7 235 aa18.98■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 TM6SF1Q9BZW5 370 aa18.98■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa18.97■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 BRD1O95696 1058 aa18.97■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa18.97■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 MCTP1Q6DN14 999 aa18.97■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 LMBRD1Q9NUN5 540 aa18.97■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 LAMB4A4D0S4 1761 aa18.96■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 C5P01031 1676 aa18.96■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 ANXA1P04083 346 aa18.96■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 PROSER3Q2NL68 480 aa18.96■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 KCNB2Q92953 911 aa18.96■□□□□ 0.63
SUCLG2-202ENST00000460567 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 SNRKQ9NRH2 765 aa18.95■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 PALD1Q9ULE6 856 aa18.95■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 MEGF6O75095 1541 aa18.95■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 NEURL1BA8MQ27 555 aa18.94■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 GCKRQ14397 625 aa18.94■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 RFX7Q2KHR2 1363 aa18.94■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa18.93■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 SUCLG2Q96I99 432 aa18.93■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 AACSQ86V21 672 aa18.93■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa18.93■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 COPRSQ9NQ92 184 aa18.93■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa18.93■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 SNX14Q9Y5W7 946 aa18.93■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 STRCP1A6NGW2 1772 aa18.92■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 ZDHHC9Q9Y397 364 aa18.92■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 IGKV5-2P06315 115 aa18.91■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 CABP4P57796 275 aa18.91■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 CCDC173Q0VFZ6 552 aa18.91■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 VPS53Q5VIR6 699 aa18.91■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 XAGE3Q8WTP9 111 aa18.91■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 TTC14Q96N46 770 aa18.91■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa18.91■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 NCLP19338 710 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 PSMA5P28066 241 aa18.9■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 RNF20Q5VTR2 975 aa18.9■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 COPS6Q7L5N1 327 aa18.9■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 KAZALD1Q96I82 304 aa18.9■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa18.9■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa18.9■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 ERVV-2B6SEH9 535 aa18.89■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.62
SUCLG2-202ENST00000460567 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa18.89■□□□□ 0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 SASH1O94885 1247 aa18.89■□□□□ 0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 PLBD2Q8NHP8 589 aa18.89■□□□□ 0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 PHF14O94880 888 aa18.88■□□□□ 0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 SLC39A6Q13433 755 aa18.88■□□□□ 0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa18.88■□□□□ 0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 LRP10Q7Z4F1 713 aa18.88■□□□□ 0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 MYD88Q99836 296 aa18.88■□□□□ 0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa18.88■□□□□ 0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 CCDC171Q6TFL3 1326 aa18.87■□□□□ 0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 CYP27B1O15528 508 aa18.87■□□□□ 0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 PKP1Q13835 747 aa18.87■□□□□ 0.61
SUCLG2-202ENST00000460567 ANKRD1Q15327 319 aa18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms