RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414868.1

CSMD2-AS1-201, CSMD2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CSMD2-AS1, Length 546 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa12.02□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 NFKBIEO00221 500 aa12.02□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 A1BGP04217 495 aa12.02□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 RGS19P49795 217 aa12.02□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 LBX1P52954 281 aa12.02□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 CREBZFQ9NS37 354 aa12.02□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 WBP1LQ9NX94 342 aa12.02□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 NRXN2Q9P2S2 1712 aa12.02□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 LAMB4A4D0S4 1761 aa12.02□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 BCORQ6W2J9 1755 aa12.01□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 VEGFBP49765 207 aa12.01□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 USP16Q9Y5T5 823 aa12.01□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP12□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 BICDL1Q6ZP65 573 aa12□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 MIS18AQ9NYP9 233 aa12□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa12□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 CNTNAP1P78357 1384 aa12□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 CARMIL3Q8ND23 1372 aa12□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 CAMTA2O94983 1202 aa11.99□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 SERPINB2P05120 415 aa11.99□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 LMOD3Q0VAK6 560 aa11.99□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 TBC1D9BQ66K14 1250 aa11.99□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 PASKQ96RG2 1323 aa11.98□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 LMNB1P20700 586 aa11.98□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 RIPK4P57078 832 aa11.98□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 CCDC146Q8IYE0 955 aa11.98□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 NBPF26B4DH59 902 aa11.97□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 TMPOP42166 694 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 NBPF15Q8N660 670 aa11.97□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa11.97□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 DLEC1Q9Y238 1755 aa11.97□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 CHADLQ6NUI6 762 aa11.96□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 RUNDC1Q96C34 613 aa11.96□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 TSPYL4Q9UJ04 414 aa11.96□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 ZNF652Q9Y2D9 606 aa11.96□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 NPHP1O15259 732 aa11.95□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 PRR5LQ6MZQ0 368 aa11.95□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 CLEC4GQ6UXB4 293 aa11.95□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 CNBD1Q8NA66 436 aa11.95□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 SETDB2Q96T68 719 aa11.95□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 ADAMTS8Q9UP79 889 aa11.95□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 RGL2O15211 777 aa11.94□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 ST5P78524 1137 aa11.94□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 NEUROD2Q15784 382 aa11.94□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 C2CD5Q86YS7 1000 aa11.94□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 BABAM1Q9NWV8 329 aa11.94□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa11.93□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 ERBB4Q15303 1308 aa11.93□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 DDNO94850 711 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 BRIP1Q9BX63 1249 aa11.93□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 CCDC85CA6NKD9 419 aa11.92□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 H0YIN7 160 aa11.92□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 PDE6BP35913 854 aa11.92□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 CCDC24Q8N4L8 307 aa11.92□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 TTLL6Q8N841 843 aa11.92□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 TRIM35Q9UPQ4 493 aa11.92□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa11.92□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 MYL6BP14649 208 aa11.91□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 KIF6Q6ZMV9 814 aa11.91□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 NGEFQ8N5V2 710 aa11.91□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP11.91□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa11.9□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 SBF1O95248 1867 aa11.9□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 HLFQ16534 295 aa11.9□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP11.9□□□□□ -0.5
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 ERVV-1B6SEH8 477 aa11.89□□□□□ -0.51
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 CHL1O00533 1208 aa11.89□□□□□ -0.51
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 TTLL7Q6ZT98 887 aa11.89□□□□□ -0.51
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 AIDAQ96BJ3 306 aa11.89□□□□□ -0.51
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 RASSF10A6NK89 507 aa11.88□□□□□ -0.51
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 TMEM88BA6NKF7 163 aa11.88□□□□□ -0.51
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 STYK1Q6J9G0 422 aa11.88□□□□□ -0.51
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 TPTE2Q6XPS3 522 aa11.88□□□□□ -0.51
CSMD2-AS1-201ENST00000414868 ZBTB3Q9H5J0 574 aa11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms