RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340369.3

XIRP1-201, Transcript of xin actin binding repeat containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene XIRP1, Length 6,460 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1-201ENST00000340369 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 ORAI2Q96SN7 254 aa14.73□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 NAPBQ9H115 298 aa14.73□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 PDE3AQ14432 1141 aa14.73□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.73□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 GRPEL1Q9HAV7 217 aa14.73□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 CDKL5O76039 1030 aa14.72□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 LIG1P18858 919 aa14.72□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 NEBLO76041 1014 aa14.72□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 CCDC87Q9NVE4 849 aa14.72□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 UQCRHLA0A096LP55 91 aa14.72□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 UQCRHP07919 91 aa14.72□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 SSR1P43307 286 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 CEP57L1Q8IYX8 460 aa14.72□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa14.72□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 ATP10BO94823 1461 aa14.72□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 DRC1Q96MC2 740 aa14.72□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 EZRP15311 586 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 TTC21AQ8NDW8 1320 aa14.71□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 KIAA1328Q86T90 577 aa14.71□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 H0YIN7 160 aa14.71□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 GCP02774 474 aa14.71□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 IQCEQ6IPM2 695 aa14.71□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.71□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
XIRP1-201ENST00000340369 CHD1LQ86WJ1 897 aa14.71□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 NUP62CLQ9H1M0 184 aa14.71□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 ANXA1P04083 346 aa14.71□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 UNC13AQ9UPW8 1703 aa14.7□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 PRKG1Q13976 671 aa14.7□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.7□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 EYA3Q99504 573 aa14.7□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 CNBD1Q8NA66 436 aa14.7□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.7□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 F6X3S4 739 aa14.7□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 ZNF804AQ7Z570 1209 aa14.7□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa14.7□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 EIF5P55010 431 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa14.7□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 CCDC102AQ96A19 550 aa14.7□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 CFAP45Q9UL16 551 aa14.7□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.7□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 BOLA2Q9H3K6 86 aa14.69□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.69□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 TAF3Q5VWG9 929 aa14.69□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 IL27Q8NEV9 243 aa14.69□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 NCOA1Q15788 1441 aa14.69□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 GSTO1P78417 241 aa14.69□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 TAF4BQ92750 862 aa14.69□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.69□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 WDR62O43379 1518 aa14.69□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 DESP17661 470 aa14.68□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.68□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.68□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 DDX11Q96FC9 970 aa14.68□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa14.68□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 WDR63Q8IWG1 891 aa14.68□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.68□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa14.68□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa14.68□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.68□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.67□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 SMTNL1A8MU46 457 aa14.67□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa14.67□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 CAMK4Q16566 473 aa14.67□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 TTC16Q8NEE8 873 aa14.67□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 SNRKQ9NRH2 765 aa14.67□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 ERICH4A6NGS2 130 aa14.66□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.66□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 CASTP20810 708 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 MAP3K9P80192 1104 aa14.66□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 ATP10AO60312 1499 aa14.66□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 ABCC10Q5T3U5 1492 aa14.66□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.66□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 WASF1Q92558 559 aa14.66□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 TNNI2P48788 182 aa14.66□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 CFAP100Q494V2 611 aa14.66□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 JAG2Q9Y219 1238 aa14.65□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa14.65□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.65□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 TRIM37O94972 964 aa14.65□□□□□ -0.06
XIRP1-201ENST00000340369 IQCA1Q86XH1 822 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms