RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335523.7

VSTM2B-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VSTM2B, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2B-201ENST00000335523 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
VSTM2B-201ENST00000335523 ATP10DQ9P241 1426 aa24.61■■□□□ 1.53
VSTM2B-201ENST00000335523 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.61■■□□□ 1.53
VSTM2B-201ENST00000335523 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.61■■□□□ 1.53
VSTM2B-201ENST00000335523 LINS1Q8NG48 757 aa24.61■■□□□ 1.53
VSTM2B-201ENST00000335523 GNAI3P08754 354 aa24.6■■□□□ 1.53
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.6■■□□□ 1.53
VSTM2B-201ENST00000335523 ARXQ96QS3 562 aa24.6■■□□□ 1.53
VSTM2B-201ENST00000335523 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa24.6■■□□□ 1.53
VSTM2B-201ENST00000335523 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.59■■□□□ 1.53
VSTM2B-201ENST00000335523 TJP1Q07157 1748 aa24.59■■□□□ 1.53
VSTM2B-201ENST00000335523 KCNQ4P56696 695 aa24.58■■□□□ 1.53
VSTM2B-201ENST00000335523 PLSCR1O15162 318 aa24.58■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 APBA3O96018 575 aa24.58■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.58■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 MYD88Q99836 296 aa24.58■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 A0A087WZG4 1122 aa24.57■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 MEIS3Q99687 375 aa24.57■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.57■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24.57■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.57■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 USP44Q9H0E7 712 aa24.56■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.55■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.55■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 GNAI2P04899 355 aa24.54■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.53■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 RPS6KA4O75676 772 aa24.53■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.53■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 IGKV5-2P06315 115 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 TCIRG1Q13488 830 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 TXNRD1Q16881 649 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.52■■□□□ 1.52
VSTM2B-201ENST00000335523 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.51■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 GCKRQ14397 625 aa24.51■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.51■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.5■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 GNPATO15228 680 aa24.5■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.5■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 AK7Q96M32 723 aa24.5■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 LY75O60449 1722 aa24.49■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 GRM8O00222 908 aa24.49■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 COL15A1P39059 1388 aa24.49■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 PROM2Q8N271 834 aa24.48■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.48■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 IGHDP01880 384 aa24.47■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 UTYO14607 1347 aa24.47■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 RREB1Q92766 1687 aa24.46■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 RGL2O15211 777 aa24.46■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 HLFQ16534 295 aa24.46■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.46■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.46■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.45■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
VSTM2B-201ENST00000335523 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
VSTM2B-201ENST00000335523 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.45■■□□□ 1.5
VSTM2B-201ENST00000335523 CAMTA2O94983 1202 aa24.45■■□□□ 1.5
VSTM2B-201ENST00000335523 CEP85Q6P2H3 762 aa24.45■■□□□ 1.5
VSTM2B-201ENST00000335523 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.45■■□□□ 1.5
VSTM2B-201ENST00000335523 HMMRO75330 724 aa24.44■■□□□ 1.5
VSTM2B-201ENST00000335523 ADRA2BP18089 450 aa24.44■■□□□ 1.5
VSTM2B-201ENST00000335523 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
VSTM2B-201ENST00000335523 ZPR1O75312 459 aa24.43■■□□□ 1.5
VSTM2B-201ENST00000335523 NARFQ9UHQ1 456 aa24.43■■□□□ 1.5
VSTM2B-201ENST00000335523 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
VSTM2B-201ENST00000335523 H7C1W4 665 aa24.42■■□□□ 1.5
VSTM2B-201ENST00000335523 ATP8B2P98198 1209 aa24.42■■□□□ 1.5
VSTM2B-201ENST00000335523 SIRT2Q8IXJ6 389 aa24.41■■□□□ 1.5
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.41■■□□□ 1.5
VSTM2B-201ENST00000335523 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.41■■□□□ 1.5
VSTM2B-201ENST00000335523 RFC4P35249 363 aa24.4■■□□□ 1.5
VSTM2B-201ENST00000335523 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
VSTM2B-201ENST00000335523 GPTP24298 496 aa24.39■■□□□ 1.5
VSTM2B-201ENST00000335523 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.39■■□□□ 1.5
VSTM2B-201ENST00000335523 NLRP10Q86W26 655 aa24.39■■□□□ 1.5
VSTM2B-201ENST00000335523 C4BP0C0L5 1744 aa24.39■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 SSFA2P28290 1259 aa24.38■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 PARP10Q53GL7 1025 aa24.38■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.38■■□□□ 1.49
VSTM2B-201ENST00000335523 GCC1Q96CN9 775 aa24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms