RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316436.3

LSMEM2-201, Transcript of leucine rich single-pass membrane protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LSMEM2, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSMEM2-201ENST00000316436 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 DEFB132Q7Z7B7 95 aa20.18■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 COG6Q9Y2V7 657 aa20.18■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 ZNF827Q17R98 1081 aa20.18■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 KSR2Q6VAB6 950 aa20.18■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.18■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 GNPATO15228 680 aa20.17■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.17■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 DNAAF4Q8WXU2 420 aa20.17■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 QSER1Q2KHR3 1735 aa20.16■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 RPS6KA4O75676 772 aa20.16■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 FKBP8Q14318 412 aa20.16■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.16■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.16■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 NEFLP07196 543 aa20.15■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.15■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.15■□□□□ 0.82
LSMEM2-201ENST00000316436 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 MS4A1P11836 297 aa20.14■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 BAG6P46379 1132 aa20.14■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 BEND3Q5T5X7 828 aa20.14■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.14■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 AKT1S1Q96B36 256 aa20.14■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 AK7Q96M32 723 aa20.14■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 CCDC125Q86Z20 511 aa20.13■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.13■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.13■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 CAMTA2O94983 1202 aa20.12■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 IGKV5-2P06315 115 aa20.12■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.12■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.12■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 COL24A1Q17RW2 1714 aa20.12■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 HLFQ16534 295 aa20.11■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 CCT4P50991 539 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 PHF14O94880 888 aa20.1■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 MYD88Q99836 296 aa20.1■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.1■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.09■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.09■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.09■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 A0A087WZG4 1122 aa20.08■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.08■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 SSFA2P28290 1259 aa20.08■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 LINS1Q8NG48 757 aa20.08■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.08■□□□□ 0.81
LSMEM2-201ENST00000316436 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.07■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 ARXQ96QS3 562 aa20.07■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 MEIS3Q99687 375 aa20.07■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.07■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 ADRA2BP18089 450 aa20.06■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 NARFQ9UHQ1 456 aa20.06■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.06■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa20.05■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 ALDH1L1O75891 902 aa20.05■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 TCIRG1Q13488 830 aa20.05■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.05■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.05■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 USP44Q9H0E7 712 aa20.05■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.04■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 GCKRQ14397 625 aa20.04■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.04■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.04■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 LAMB2P55268 1798 aa20.04■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 SLC15A2Q16348 729 aa20.03■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.03■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 CASZ1Q86V15 1759 aa20.02■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 UTYO14607 1347 aa20.02■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 RGL2O15211 777 aa20.02■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 GPTP24298 496 aa20.02■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.02■□□□□ 0.8
LSMEM2-201ENST00000316436 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
LSMEM2-201ENST00000316436 RFC4P35249 363 aa20.01■□□□□ 0.79
LSMEM2-201ENST00000316436 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
LSMEM2-201ENST00000316436 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.01■□□□□ 0.79
LSMEM2-201ENST00000316436 NLRP10Q86W26 655 aa20.01■□□□□ 0.79
LSMEM2-201ENST00000316436 GYS1P13807 737 aa20■□□□□ 0.79
LSMEM2-201ENST00000316436 CASP7P55210 303 aa20■□□□□ 0.79
LSMEM2-201ENST00000316436 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20■□□□□ 0.79
LSMEM2-201ENST00000316436 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms