RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262124.15

SEH1L-201, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEH1L, Length 3,494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-201ENST00000262124 TRAK2O60296 914 aa14.85□□□□□ -0.03
SEH1L-201ENST00000262124 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SEH1L-201ENST00000262124 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa14.85□□□□□ -0.03
SEH1L-201ENST00000262124 GPTP24298 496 aa14.85□□□□□ -0.03
SEH1L-201ENST00000262124 KAZALD1Q96I82 304 aa14.85□□□□□ -0.03
SEH1L-201ENST00000262124 AK9Q5TCS8 1911 aa14.85□□□□□ -0.03
SEH1L-201ENST00000262124 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa14.85□□□□□ -0.03
SEH1L-201ENST00000262124 MCTP1Q6DN14 999 aa14.84□□□□□ -0.03
SEH1L-201ENST00000262124 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SEH1L-201ENST00000262124 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SEH1L-201ENST00000262124 BABAM1Q9NWV8 329 aa14.84□□□□□ -0.03
SEH1L-201ENST00000262124 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.84□□□□□ -0.03
SEH1L-201ENST00000262124 RABEP1Q15276 862 aa14.84□□□□□ -0.03
SEH1L-201ENST00000262124 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SEH1L-201ENST00000262124 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
SEH1L-201ENST00000262124 SLFNL1Q499Z3 407 aa14.83□□□□□ -0.03
SEH1L-201ENST00000262124 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.83□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 IL2RBP14784 551 aa14.83□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 GCKRQ14397 625 aa14.83□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.83□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 ACSBG1Q96GR2 724 aa14.83□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 SASH1O94885 1247 aa14.82□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 SYNE4Q8N205 404 aa14.82□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 FAM227BQ96M60 508 aa14.82□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 NBPF26B4DH59 902 aa14.82□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 PPFIA3O75145 1194 aa14.82□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 HOXB7P09629 217 aa14.82□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 NBPF14Q5TI25 921 aa14.82□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 CNTROBQ8N137 903 aa14.82□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 NBPF15Q8N660 670 aa14.82□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 MCCP23508 829 aa14.81□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 FSD1Q9BTV5 496 aa14.81□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 TNS3Q68CZ2 1445 aa14.81□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.81□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 POLA2Q14181 598 aa14.8□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 TFCP2Q12800 502 aa14.8□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 SNX21Q969T3 373 aa14.8□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.8□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 KCNQ4P56696 695 aa14.8□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 TIMM10P62072 90 aa14.8□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 GDPD2Q9HCC8 539 aa14.8□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 RAB11FIP3O75154 756 aa14.79□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 DNAJC10Q8IXB1 793 aa14.79□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 RASEFQ8IZ41 740 aa14.79□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.79□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 ECHDC1Q9NTX5 307 aa14.79□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 FAM89AQ96GI7 184 aa14.79□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 PANK2Q9BZ23 570 aa14.79□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 WDR17Q8IZU2 1322 aa14.79□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 ALDH1L1O75891 902 aa14.79□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 PTH1RQ03431 593 aa14.79□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 TMX3Q96JJ7 454 aa14.79□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.78□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 SNRKQ9NRH2 765 aa14.78□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa14.78□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.78□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 GBP4Q96PP9 640 aa14.78□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.78□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 GPATCH3Q96I76 525 aa14.77□□□□□ -0.04
SEH1L-201ENST00000262124 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 CASTP20810 708 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa14.77□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 SMIM5Q71RC9 77 aa14.76□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 DBNDD2Q9BQY9 259 aa14.76□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.76□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa14.75□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa14.75□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 STK3Q13188 491 aa14.75□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.75□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.75□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 LRRC24Q50LG9 513 aa14.75□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 FAM182BQ5T319 152 aa14.75□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 PIGBQ92521 554 aa14.75□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 STAP2Q9UGK3 403 aa14.75□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 FOSBP53539 338 aa14.74□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.74□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.74□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa14.74□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 SGSM2O43147 1006 aa14.74□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 NECAB1Q8N987 351 aa14.74□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.74□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 A0A0D9SFI3 127 aa14.73□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 GOLGA6L22H0YM25 854 aa14.73□□□□□ -0.05
SEH1L-201ENST00000262124 BAG4O95429 457 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms