RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.09■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.09■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 SYT1P21579 422 aa22.09■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 CUL4AQ13619 759 aa22.09■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.08■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.08■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 RAD50Q92878 1312 aa22.08■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.08■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 PROSER3Q2NL68 480 aa22.08■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
LRP3-201ENST00000253193 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.08■■□□□ 1.12
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LRP3-201ENST00000253193 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.07■■□□□ 1.12
LRP3-201ENST00000253193 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.07■■□□□ 1.12
LRP3-201ENST00000253193 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
LRP3-201ENST00000253193 FOSBP53539 338 aa22.07■■□□□ 1.12
LRP3-201ENST00000253193 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.06■■□□□ 1.12
LRP3-201ENST00000253193 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.06■■□□□ 1.12
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LRP3-201ENST00000253193 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
LRP3-201ENST00000253193 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
LRP3-201ENST00000253193 PTH1RQ03431 593 aa22.06■■□□□ 1.12
LRP3-201ENST00000253193 RNF20Q5VTR2 975 aa22.06■■□□□ 1.12
LRP3-201ENST00000253193 DRC7Q8IY82 874 aa22.06■■□□□ 1.12
LRP3-201ENST00000253193 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.05■■□□□ 1.12
LRP3-201ENST00000253193 KSR2Q6VAB6 950 aa22.05■■□□□ 1.12
LRP3-201ENST00000253193 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.05■■□□□ 1.12
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LRP3-201ENST00000253193 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.05■■□□□ 1.12
LRP3-201ENST00000253193 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.04■■□□□ 1.12
LRP3-201ENST00000253193 GCP02774 474 aa22.04■■□□□ 1.12
LRP3-201ENST00000253193 UQCRHP07919 91 aa22.04■■□□□ 1.12
LRP3-201ENST00000253193 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.04■■□□□ 1.12
LRP3-201ENST00000253193 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.04■■□□□ 1.12
LRP3-201ENST00000253193 RUFY3Q7L099 469 aa22.04■■□□□ 1.12
LRP3-201ENST00000253193 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.04■■□□□ 1.12
LRP3-201ENST00000253193 ORAI2Q96SN7 254 aa22.04■■□□□ 1.12
LRP3-201ENST00000253193 FAM227BQ96M60 508 aa22.04■■□□□ 1.12
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LRP3-201ENST00000253193 AOX1Q06278 1338 aa22.04■■□□□ 1.12
LRP3-201ENST00000253193 DIP2BQ9P265 1576 aa22.04■■□□□ 1.12
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LRP3-201ENST00000253193 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.03■■□□□ 1.12
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LRP3-201ENST00000253193 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.02■■□□□ 1.12
LRP3-201ENST00000253193 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.02■■□□□ 1.12
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LRP3-201ENST00000253193 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
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LRP3-201ENST00000253193 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.01■■□□□ 1.11
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LRP3-201ENST00000253193 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.01■■□□□ 1.11
LRP3-201ENST00000253193 H3BQV1 296 aa22.01■■□□□ 1.11
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LRP3-201ENST00000253193 UBE2HP62256 183 aa22■■□□□ 1.11
LRP3-201ENST00000253193 FAM173BQ6P4H8 233 aa22■■□□□ 1.11
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LRP3-201ENST00000253193 SUCLG2Q96I99 432 aa22■■□□□ 1.11
LRP3-201ENST00000253193 LARGE1O95461 756 aa22■■□□□ 1.11
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LRP3-201ENST00000253193 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.98■■□□□ 1.11
LRP3-201ENST00000253193 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
LRP3-201ENST00000253193 COPS6Q7L5N1 327 aa21.98■■□□□ 1.11
LRP3-201ENST00000253193 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.98■■□□□ 1.11
LRP3-201ENST00000253193 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.98■■□□□ 1.11
LRP3-201ENST00000253193 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
LRP3-201ENST00000253193 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
LRP3-201ENST00000253193 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
LRP3-201ENST00000253193 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
LRP3-201ENST00000253193 HS1BP3Q53T59 392 aa21.97■■□□□ 1.11
LRP3-201ENST00000253193 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.97■■□□□ 1.11
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