RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000176549.1

Gm28727-201, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Gm28727, Length 443 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Kcnc4Q8R1C0 628 aa15.21■□□□□ 0.03
Gm28727-201ENSMUST00000176549 AfdnQ9QZQ1 1820 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Dctn1O08788 1281 aa15.2■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Map3k9Q3U1V8 1077 aa15.2■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Foxn1Q61575 648 aa15.2■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Slc39a6Q8C145 765 aa15.2■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Mylk2Q8VCR8 613 aa15.2■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Pbx4Q99NE9 378 aa15.2■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Mrc1Q61830 1456 aa15.2■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa15.19■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Prpmp5E9PXN1 296 aa15.19■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Cnnm1Q0GA42 951 aa15.19■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Zscan10Q3URR7 782 aa15.19■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 SowahdQ8BY98 327 aa15.19■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Ttc5Q99LG4 440 aa15.19■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Ankrd13cQ3UX43 541 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Atp2b4Q6Q477 1205 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Igf2bp3Q9CPN8 579 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Cabp2Q9JLK4 216 aa15.18■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 NynrinQ5DTZ0 1840 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Evi5P97366 809 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Mansc4Q3UU94 337 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Btbd11Q6GQW0 1109 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Htra3Q9D236 459 aa15.17■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Glt1d1A4FUP9 346 aa15.16■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Pde4bB1AWC9 736 aa15.16■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Bcl2l13P59017 434 aa15.16■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Atxn2lQ7TQH0 1049 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Tm4sf4Q91XD3 202 aa15.16■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Polr2aP08775 1970 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Eif6O55135 245 aa15.15■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Map9Q3TRR0 646 aa15.15■□□□□ 0.02
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Tom1l2Q5SRX1 507 aa15.14■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 RubcnQ80U62 956 aa15.14■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Stk31Q99MW1 1018 aa15.14■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Mapk8ip1Q9WVI9 707 aa15.14■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Flt4P35917 1363 aa15.13■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Prr14lE9Q7C4 1971 aa15.13■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Gm42688A0A0R3P9D1 673 aa15.13■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Atp6v0a2P15920 856 aa15.13■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Strip1Q8C079 837 aa15.13■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Ccdc142Q8CAI1 738 aa15.13■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa15.13■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Pcdh15Q99PJ1 1943 aa15.13■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 LtbrP50284 415 aa15.12■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Zc3h12cQ5DTV4 884 aa15.12■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Pcsk7Q61139 770 aa15.12■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Klf15Q9EPW2 415 aa15.12■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Celf2Q9Z0H4 508 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Duox1A2AQ92 1551 aa15.11■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Zmynd8A2A484 1235 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Cxcl9P18340 126 aa15.11■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Pdia6Q922R8 440 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Flad1Q8R123 492 aa15.1■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Ly6iQ9WU67 134 aa15.1■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Ssc5dQ8BV57 1371 aa15.1■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Npy5rO70342 466 aa15.09■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Prim1P20664 417 aa15.09■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Cct4P80315 539 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Skor1Q8BX46 964 aa15.09■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Dpp7Q9ET22 506 aa15.09■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Brpf1B2RRD7 1212 aa15.08■□□□□ 0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Sox10Q04888 466 aa15.08■□□□□ 0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Iqsec3Q3TES0 1195 aa15.08■□□□□ 0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Gimap8Q75N62 688 aa15.08■□□□□ 0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Susd4Q8BH32 490 aa15.08■□□□□ 0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Ptrh1Q8BW00 204 aa15.08■□□□□ 0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa15.08■□□□□ 0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Gm42715A0A087WP63 3095 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 GmpsQ3THK7 693 aa15.07■□□□□ 0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Abcc12Q80WJ6 1366 aa15.07■□□□□ 0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Igfbp6P47880 238 aa15.06■□□□□ 0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 OsbpQ3B7Z2 805 aa15.06■□□□□ 0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa15.06■□□□□ 0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Fzd9Q9R216 592 aa15.06■□□□□ 0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Tnip1Q9WUU8 647 aa15.06■□□□□ 0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Arih1Q9Z1K5 555 aa15.06■□□□□ 0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Zfp777B9EKF4 885 aa15.05■□□□□ -0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Tnnt1O88346 262 aa15.05■□□□□ -0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Eva1cP58659 440 aa15.05■□□□□ -0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Tmem130Q6NXM3 419 aa15.05■□□□□ -0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 TefQ9JLC6 301 aa15.05■□□□□ -0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Ltn1Q6A009 1767 aa15.05■□□□□ -0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Glis3Q6XP49 780 aa15.04■□□□□ -0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Ccdc93Q7TQK5 629 aa15.04■□□□□ -0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Sp8Q8BMJ8 486 aa15.04■□□□□ -0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Shtn1Q8K2Q9 631 aa15.04■□□□□ -0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Myoz2Q9JJW5 264 aa15.04■□□□□ -0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa15.04■□□□□ -0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Tanc1Q0VGY8 1856 aa15.03■□□□□ -0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Prr29B1ARI9 187 aa15.03■□□□□ -0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Aknad1E9Q8N6 675 aa15.03■□□□□ -0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Hspa2P17156 633 aa15.03■□□□□ -0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Ggnbp2Q5SV77 696 aa15.03■□□□□ -0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Eddm13E9Q7F5 164 aa15.02■□□□□ -0
Gm28727-201ENSMUST00000176549 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.3 ms