RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 ABATP80404 500 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 PMP22Q01453 160 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA0040Q15053 153 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 IMPG1Q17R60 797 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 HKDC1Q2TB90 917 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 PAQR7Q86WK9 346 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 C17orf64Q86WR6 236 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 SNX32Q86XE0 403 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4K1Q8NGD4 311 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJB8Q8NHS0 232 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 ACPTQ9BZG2 426 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 NMRK1Q9NWW6 199 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 MTORP42345 2549 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 BBIP1A8MTZ0 92 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 RASAL1O95294 804 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT16P08779 473 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 HRH2P25021 359 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINB1P30740 379 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 PIK3CBP42338 1070 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNJ2P63252 427 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 AGKQ53H12 422 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 OR7G3Q8NG95 312 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 MVB12AQ96EY5 273 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 CHST11Q9NPF2 352 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 SIRT5Q9NXA8 310 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 SEC14L3Q9UDX4 400 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 C19orf84I3L1E1 186 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 PRAMEF2O60811 474 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 PRPS2P11908 318 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 MAPK1P28482 360 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 DIO3P55073 304 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 SYT16Q17RD7 645 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF425Q6IV72 752 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 RPTNQ6XPR3 784 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 HACD2Q6Y1H2 254 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 FUNDC1Q8IVP5 155 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT78Q8N1N4 520 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF2BQ8N4N8 673 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 POU5F2Q8N7G0 328 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 MARK4Q96L34 752 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 FCRL1Q96LA6 429 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2A5Q96R48 311 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 ACAT2Q9BWD1 397 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 C14orf105Q9NVL8 296 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 CACNA1CQ13936 2221 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 OR5H15A6NDH6 313 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC22A3O75751 556 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 CRYABP02511 175 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 IL23RQ5VWK5 629 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM219BQ5XKK7 198 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 SUSD1Q6UWL2 747 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 CSNK1A1LQ8N752 337 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS29Q9UBQ0 182 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 GIMAP2Q9UG22 337 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFAF1Q9Y375 327 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-216ENST00000628306 SCN2AQ99250 2005 aa22.58■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 H0YHG0 523 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 P2RX6O15547 441 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 SEC22BO75396 215 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 HEXBP07686 556 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 CPA2P48052 419 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 NEK2P51955 445 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 HMGCS1Q01581 520 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 TESK1Q15569 626 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 C3AR1Q16581 482 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 SGO1Q5FBB7 561 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 CATSPEREQ5SY80 951 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 PAOXQ6QHF9 649 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 C16orf89Q6UX73 402 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 TMPRSS11BQ86T26 416 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 RHBGQ9H310 441 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC52A3Q9NQ40 469 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC167Q9P0B6 97 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 CDC14AQ9UNH5 594 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 MED13LQ71F56 2210 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM234BA2RU67 622 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD28O15084 1053 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC19A2O60779 497 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 CCNDBP1O95273 360 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 COX6B1P14854 86 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 JAK1P23458 1154 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 CMPK1P30085 196 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-216ENST00000628306 CCR8P51685 355 aa22.56■■□□□ 1.2
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