RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 H3BNX3 289 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 CXCR6O00574 342 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFRSF21O75509 655 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 NUDT7P0C024 238 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 ETFAP13804 333 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 PTGER1P34995 402 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 CRATP43155 626 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 VMACQ2NL98 169 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFP1Q6P2D0 407 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF595Q8IYB9 648 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLM1Q8NBJ4 401 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 NCDNQ9UBB6 729 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 MAU2Q9Y6X3 613 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1B0GX78 115 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 TCRBV5S2A0A599 114 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 GMNNO75496 209 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 BMP2P12643 396 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP2R1BP30154 601 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 PDX1P52945 283 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 CASP9P55211 416 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 POLE2P56282 527 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 ID2Q02363 134 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM107Q6UX40 140 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 MED25Q71SY5 747 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 OR52E4Q8NGH9 312 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 FIG4Q92562 907 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 MOAP1Q96BY2 351 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D20Q96BZ9 403 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 ELP4Q96EB1 424 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 NSMCE2Q96MF7 247 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 RBCK1Q9BYM8 510 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 RARRES3Q9UL19 164 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 SRPK3Q9UPE1 567 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 C4orf47A7E2U8 309 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 CTNSO60931 367 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP1B1P05026 303 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 OR1D4P47884 311 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 C16orf72Q14CZ0 275 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 LTB4RQ15722 352 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 RHBDD2Q6NTF9 364 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 COL26A1Q96A83 441 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 OCIAD1Q9NX40 245 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 SCN2AQ99250 2005 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 TGM1P22735 817 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
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CAPNS1-215ENST00000628018 MC3RP41968 323 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 XCR1P46094 333 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 TP53BP2Q13625 1128 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 VEZF1Q14119 521 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 DSG2Q14126 1118 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 MTX3Q5HYI7 312 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM38AQ9H6F2 299 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF304Q9HCX3 659 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 AGRPO00253 132 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 PLOD2O00469 737 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 CLDN4O14493 209 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 EMC8O43402 210 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 CREG1O75629 220 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 FHP07954 510 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 ANPEPP15144 967 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 RBBP4Q09028 425 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP7Q14244 749 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 ERV3-1Q14264 604 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 GCNT6Q5T4J0 391 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 BHLHB9Q6PI77 547 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 AGBL5Q8NDL9 886 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 ADCY4Q8NFM4 1077 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 OR56A1Q8NGH5 318 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 NETO1Q8TDF5 533 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 CANT1Q8WVQ1 401 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 SLCO4A1Q96BD0 722 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 CDC6Q99741 560 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 C3orf14Q9HBI5 128 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM86C1Q9NVL1 165 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 NTMQ9P121 344 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC35E2P0CK97 266 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC7A1P30825 629 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 SOX18P35713 384 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 HSD17B7P56937 341 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 PRR5P85299 388 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC13A2Q13183 592 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF628Q5EBL2 1059 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF111Q6ZNA4 994 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 HORMAD2Q8N7B1 307 aa23.34■■□□□ 1.33
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