RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 PLGLB1Q02325 96 aa20.34■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 FOXO1Q12778 655 aa20.34■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 PIGGQ5H8A4 983 aa20.34■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 EMC4Q5J8M3 183 aa20.34■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 PAOXQ6QHF9 649 aa20.34■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 LYPD8Q6UX82 237 aa20.34■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
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SRRT-218ENST00000620394 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
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SRRT-218ENST00000620394 IL1RL2Q9HB29 575 aa20.34■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
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SRRT-218ENST00000620394 HRKO00198 91 aa20.33■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 CCL3P10147 92 aa20.33■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 NR2F6P10588 404 aa20.33■□□□□ 0.85
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SRRT-218ENST00000620394 KLK2P20151 261 aa20.33■□□□□ 0.85
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SRRT-218ENST00000620394 ADGRD1Q6QNK2 874 aa20.33■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 NUDT13Q86X67 352 aa20.33■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 FAM109AQ8N4B1 249 aa20.33■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 SLC15A4Q8N697 577 aa20.33■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 SLC22A8Q8TCC7 542 aa20.33■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 DEFB127Q9H1M4 99 aa20.33■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 VPS11Q9H270 941 aa20.33■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 TMCO1Q9UM00 188 aa20.33■□□□□ 0.85
SRRT-218ENST00000620394 EXPH5Q8NEV8 1989 aa20.33■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 A0A1B0GVC2 190 aa20.32■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 A0A1W2PR48 441 aa20.32■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 G3V3Y1 287 aa20.32■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa20.32■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 OR7A17O14581 309 aa20.32■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 STX16O14662 325 aa20.32■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 PDE9AO76083 593 aa20.32■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 CLDN9O95484 217 aa20.32■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 GPR75O95800 540 aa20.32■□□□□ 0.84
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SRRT-218ENST00000620394 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
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SRRT-218ENST00000620394 OR52B6Q8NGF0 335 aa20.32■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 NTMT1Q9BV86 223 aa20.32■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 TSPYL1Q9H0U9 437 aa20.32■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 ZNF358Q9NW07 568 aa20.32■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 XPR1Q9UBH6 696 aa20.32■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 PCTPQ9UKL6 214 aa20.32■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 LIPGQ9Y5X9 500 aa20.32■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 NCKAP5O14513 1909 aa20.31■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 AIFM1O95831 613 aa20.31■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 CLPSP04118 112 aa20.31■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 P04436 131 aa20.31■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 INHBAP08476 426 aa20.31■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 FAM58BPP0C7Q3 252 aa20.31■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 DNASE1L1P49184 302 aa20.31■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 SERPINB9P50453 376 aa20.31■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 NUP107P57740 925 aa20.31■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 HERVK_113P63132 956 aa20.31■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 ERVK-8P63133 956 aa20.31■□□□□ 0.84
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SRRT-218ENST00000620394 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa20.31■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 GGTA1PQ4G0N0 100 aa20.31■□□□□ 0.84
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SRRT-218ENST00000620394 TRILQ7L0X0 811 aa20.31■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 OR5M3Q8NGP4 307 aa20.31■□□□□ 0.84
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SRRT-218ENST00000620394 SERPINI1Q99574 410 aa20.31■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 ERVK-6Q9BXR3 956 aa20.31■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 ERVK-19Q9WJR5 959 aa20.31■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 OR6C76A6NM76 312 aa20.3■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 ACSL3O95573 720 aa20.3■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 FBXO45P0C2W1 286 aa20.3■□□□□ 0.84
SRRT-218ENST00000620394 MAGEA5P43359 124 aa20.3■□□□□ 0.84
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