RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614484.4

SRRT-215, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRRT, Length 2,964 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-215ENST00000614484 USP30Q70CQ3 517 aa11.45□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 DNAJB8Q8NHS0 232 aa11.45□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 HMGCLL1Q8TB92 370 aa11.45□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 FAM45AQ8TCE6 357 aa11.45□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 BTN2A2Q8WVV5 523 aa11.45□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 FGF22Q9HCT0 170 aa11.45□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 FZD4Q9ULV1 537 aa11.45□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 CACNA1EQ15878 2313 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 RGS5O15539 181 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 YES1P07947 543 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 GNSP15586 552 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 ZNF250P15622 560 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 CD40LGP29965 261 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 SHMT2P34897 504 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 CYP51A1Q16850 503 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 IMPG1Q17R60 797 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 MANEAQ5SRI9 462 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 TCEAL6Q6IPX3 200 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 BHLHB9Q6PI77 547 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 NLRC3Q7RTR2 1065 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 RDH11Q8TC12 318 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 DTD1Q8TEA8 209 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 TCEAL3Q969E4 200 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 SGTBQ96EQ0 304 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 ZNF251Q9BRH9 671 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 SLC23A2Q9UGH3 650 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 ZNF217O75362 1048 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 CFIP05156 583 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 QDPRP09417 244 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 MYF5P13349 255 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 IL7RP16871 459 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 ALDH4A1P30038 563 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 CLCN5P51795 746 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 PIGFQ07326 219 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 CSHL1Q14406 222 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 TEX30Q5JUR7 227 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 HECTD2Q5U5R9 776 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 TMEM236Q5W0B7 351 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 KIAA0895LQ68EN5 471 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 MZT2AQ6P582 158 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 PAQR3Q6TCH7 311 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 TMEM207Q6UWW9 146 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 VRK3Q8IV63 474 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 CCDC103Q8IW40 242 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 CFAP206Q8IYR0 622 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 OR9I1Q8NGQ6 314 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 ISL2Q96A47 359 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 CCDC90BQ9GZT6 254 aa11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 L7N2F9 121 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 LDLRP01130 860 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 MT-ND1P03886 318 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 NTRK1P04629 796 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 THEGLP0DJG4 465 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 HTR3AP46098 478 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 RAB4BP61018 213 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 ACVR1Q04771 509 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 Q5BKY6 102 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 C1orf185Q5T7R7 199 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 ZBTB37Q5TC79 503 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 LINC00299Q6ZSB3 139 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 ING3Q9NXR8 418 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 THADAQ6YHU6 1953 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 A0A1B0GV90 55 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 H0YAE9 185 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 NME4O00746 187 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 KLHL18O94889 574 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 WNT1P04628 370 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 S100PP25815 95 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 TTPAP49638 278 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 EFR3AQ14156 821 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 GCNT7Q6ZNI0 430 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 TRAM1L1Q8N609 369 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 NANPQ8TBE9 248 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 ELMO1Q92556 727 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 ESAMQ96AP7 390 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 APOOQ9BUR5 198 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 SGK2Q9HBY8 427 aa11.43□□□□□ -0.58
SRRT-215ENST00000614484 FBXO8Q9NRD0 319 aa11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms