RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa10.86□□□□□ -0.67
HCG18-241ENST00000602290 COG4Q9H9E3 785 aa10.86□□□□□ -0.67
HCG18-241ENST00000602290 MMP25Q9NPA2 562 aa10.86□□□□□ -0.67
HCG18-241ENST00000602290 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP10.86□□□□□ -0.672e-10■■□□□ 14.3
HCG18-241ENST00000602290 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa10.86□□□□□ -0.67
HCG18-241ENST00000602290 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
HCG18-241ENST00000602290 A0A1W2PPM1 405 aa10.85□□□□□ -0.67
HCG18-241ENST00000602290 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa10.85□□□□□ -0.67
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HCG18-241ENST00000602290 BCKDKO14874 412 aa10.85□□□□□ -0.67
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HCG18-241ENST00000602290 ALX3O95076 343 aa10.85□□□□□ -0.67
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HCG18-241ENST00000602290 CALB1P05937 261 aa10.85□□□□□ -0.67
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HCG18-241ENST00000602290 HYAL4Q2M3T9 481 aa10.85□□□□□ -0.67
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HCG18-241ENST00000602290 C1orf185Q5T7R7 199 aa10.85□□□□□ -0.67
HCG18-241ENST00000602290 ZNF585AQ6P3V2 769 aa10.85□□□□□ -0.67
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HCG18-241ENST00000602290 SH2D5Q6ZV89 423 aa10.85□□□□□ -0.67
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HCG18-241ENST00000602290 SULF2Q8IWU5 870 aa10.85□□□□□ -0.67
HCG18-241ENST00000602290 CFAP206Q8IYR0 622 aa10.85□□□□□ -0.67
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HCG18-241ENST00000602290 TRIM63Q969Q1 353 aa10.85□□□□□ -0.67
HCG18-241ENST00000602290 CLPTM1LQ96KA5 538 aa10.85□□□□□ -0.67
HCG18-241ENST00000602290 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa10.85□□□□□ -0.67
HCG18-241ENST00000602290 BCL7BQ9BQE9 202 aa10.85□□□□□ -0.67
HCG18-241ENST00000602290 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
HCG18-241ENST00000602290 TRPC4Q9UBN4 977 aa10.85□□□□□ -0.67
HCG18-241ENST00000602290 PCSK1NQ9UHG2 260 aa10.85□□□□□ -0.67
HCG18-241ENST00000602290 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
HCG18-241ENST00000602290 EVPLLA8MZ36 301 aa10.84□□□□□ -0.67
HCG18-241ENST00000602290 RNF223E7ERA6 249 aa10.84□□□□□ -0.67
HCG18-241ENST00000602290 E7ESA3 106 aa10.84□□□□□ -0.67
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HCG18-241ENST00000602290 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
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HCG18-241ENST00000602290 KRT80Q6KB66 452 aa10.84□□□□□ -0.67
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HCG18-241ENST00000602290 IGHG3P01860 377 aa10.83□□□□□ -0.68
HCG18-241ENST00000602290 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
HCG18-241ENST00000602290 CYC1P08574 325 aa10.83□□□□□ -0.68
HCG18-241ENST00000602290 MSH3P20585 1137 aa10.83□□□□□ -0.68
HCG18-241ENST00000602290 FPR1P21462 350 aa10.83□□□□□ -0.68
HCG18-241ENST00000602290 BMP5P22003 454 aa10.83□□□□□ -0.68
HCG18-241ENST00000602290 MIPP30301 263 aa10.83□□□□□ -0.68
HCG18-241ENST00000602290 AKT1P31749 480 aa10.83□□□□□ -0.68
HCG18-241ENST00000602290 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
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