RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 OR4C11Q6IEV9 310 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 POMZP3Q6PJE2 187 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 PAMR1Q6UXH9 720 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 CAPN12Q6ZSI9 719 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC29A4Q7RTT9 530 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 MAATS1Q7Z4T9 603 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 CAMKMTQ7Z624 323 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 LACC1Q8IV20 430 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ZBED8Q8IZ13 594 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 TNIP2Q8NFZ5 429 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 OR7G3Q8NG95 312 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 EXT2Q93063 718 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC46Q96FV0 321 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 UBXN10Q96LJ8 280 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF597Q96LX8 424 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 GAL3ST4Q96RP7 486 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 GPR22Q99680 433 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ERVK-6Q9BXR3 956 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIM31Q9BZY9 425 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 WWTR1Q9GZV5 400 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 OR51B5Q9H339 312 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 PHF11Q9UIL8 331 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ERVK-19Q9WJR5 959 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 EXPH5Q8NEV8 1989 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKRD33BA6NCL7 494 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 OR6C76A6NM76 312 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 PLPP1O14494 284 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 FOSL1P15407 271 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 STMN1P16949 149 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 RAP1GDS1P52306 607 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF136P52737 540 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 WNT3P56703 355 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC37A1P57057 533 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 RAB10P61026 200 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 TBCELQ5QJ74 424 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 GRHL2Q6ISB3 625 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF111Q6ZNA4 994 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 GPR180Q86V85 440 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF175Q8N4F7 328 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 DOK4Q8TEW6 326 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 UBTD2Q8WUN7 234 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 CDKL2Q92772 493 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 RGMAQ96B86 450 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 RBBP8Q99708 897 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 TIMP4Q99727 224 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 CPNE1Q99829 537 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 CENPKQ9BS16 269 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 PRDM14Q9GZV8 571 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ALG9Q9H6U8 611 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 NUDT4Q9NZJ9 180 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 TXNDC16Q9P2K2 825 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ADGRE2Q9UHX3 823 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 IKBKGQ9Y6K9 419 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 DOCK7Q96N67 2140 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 TUBAL3A6NHL2 446 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 EFCAB8A8MWE9 144 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 K7EPI3 171 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 OR10H2O60403 315 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 GPR75O95800 540 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 IL2RAP01589 272 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 RAF1P04049 648 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 CLPSP04118 112 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 DRD2P14416 443 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 SSTR1P30872 391 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 GALNSP34059 522 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 GMPRP36959 345 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 GP5P40197 560 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 PIK3CBP42338 1070 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 RPL21P46778 160 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ARFIP1P53367 373 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 RPS6KA2Q15349 733 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM198Q66K66 360 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ISCA2Q86U28 154 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 CREG2Q8IUH2 290 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 PM20D2Q8IYS1 436 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 TAGAPQ8N103 731 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF441Q8N8Z8 693 aa9.44□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 HUS1BQ8NHY5 278 aa9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms