RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 NIPAL1Q6NVV3 410 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 TUBA3EQ6PEY2 450 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM64Q6YI46 380 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 ADCK2Q7Z695 626 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC15A4Q8N697 577 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 AMER2Q8N7J2 671 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 AQP11Q8NBQ7 271 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 PLA2G15Q8NCC3 412 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 OR2L8Q8NGY9 312 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 RHOXF1Q8NHV9 184 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 PSMA8Q8TAA3 256 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 APH1BQ8WW43 257 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 FGF13Q92913 245 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 TM4SF18Q96CE8 201 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 ZFYVE19Q96K21 471 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 ALPK1Q96QP1 1244 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 FERD3LQ96RJ6 166 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 SIGLEC11Q96RL6 698 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 CSF3RQ99062 836 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 MYOCQ99972 504 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 ACAT2Q9BWD1 397 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 CXorf36Q9H7Y0 433 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 FBXO8Q9NRD0 319 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 GPATCH2Q9NW75 528 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 FKBP14Q9NWM8 211 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 CLN6Q9NWW5 311 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 RHBDL2Q9NX52 303 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 GIN1Q9NXP7 522 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 TAS2R7Q9NYW3 318 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 ERVK-11Q9UQG0 969 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 ENTPD4Q9Y227 616 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 ERGIC3Q9Y282 383 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 DGKBQ9Y6T7 804 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 A3GALT2U3KPV4 340 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 COL4A3Q01955 1670 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 SAGE2PA6NJ88 616 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 OR1F1O43749 312 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC28A2O43868 658 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 AIREO43918 545 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 PRAMEF10O60809 474 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 UGT2B17O75795 530 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 C1QCP02747 245 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 H1F0P07305 194 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 PIPP12273 146 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 ACVR2AP27037 513 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 OPRD1P41143 372 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 OPRL1P41146 370 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 CTSKP43235 329 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 TSFMP43897 325 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 OR1E2P47887 323 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 CRISP3P54108 245 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 RPS21P63220 83 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 HSPB3Q12988 150 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 TP53BP2Q13625 1128 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 WSCD2Q2TBF2 565 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM16LQ309B1 348 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 DCST1Q5T197 706 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 OR4C11Q6IEV9 310 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF740Q8NDX6 193 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM46DQ8NEK8 389 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 OR56A1Q8NGH5 318 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 OR52J3Q8NH60 311 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 NDNFQ8TB73 568 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 TANKQ92844 425 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 DNASE1L2Q92874 299 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM19Q96HH6 336 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF354BQ96LW1 612 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 C12orf66Q96MD2 445 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 F2RL3Q96RI0 385 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 UCK2Q9BZX2 261 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 MMP27Q9H306 513 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 AKIP1Q9NQ31 210 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 ACER3Q9NUN7 267 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 SEC14L3Q9UDX4 400 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 SH3GLB1Q9Y371 365 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 PRKAB1Q9Y478 270 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 STON1Q9Y6Q2 735 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 DOCK6Q96HP0 2047 aa8.71□□□□□ -1.01
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A0A6YYD5 115 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 IRGMA1A4Y4 181 aa8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 148.5 ms