RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-209	ENST00000589469	APIP	Q96GX9	242 aa		18.62	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	PSME2	Q9UL46	239 aa		18.62	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		18.62	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469		A0A1W2PS29	197 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469		A8MVJ9	347 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	HRK	O00198	91 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	ALDH9A1	P49189	494 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	XK	P51811	444 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	BTK	Q06187	659 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	MMP21	Q8N119	569 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	NUBPL	Q8TB37	319 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	RASL10B	Q96S79	203 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	MECR	Q9BV79	373 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	HPF1	Q9NWY4	346 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		18.61	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	ASPDH	A6ND91	283 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	CPM	P14384	443 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	CREB1	P16220	341 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	SERPINB3	P29508	390 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	TDGF1P3	P51864	188 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	KLHL29	Q96CT2	875 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		18.6	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	NBAS	A2RRP1	2371 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	OR6C76	A6NM76	312 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	AZIN1	O14977	448 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	TYROBP	O43914	113 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	NPHS1	O60500	1241 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	OR6B1	O95007	311 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	AGFG2	O95081	481 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	IL3	P08700	152 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	NT5E	P21589	574 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	MST1	P26927	711 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	SOX3	P41225	446 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	GSTM5	P46439	218 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	MPEG1	Q2M385	716 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	OPN5	Q6U736	354 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	CROCCP2	Q86T23	111 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	FRMD6	Q96NE9	622 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	ZIM3	Q96PE6	472 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	EBPL	Q9BY08	206 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	CENPH	Q9H3R5	247 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		18.59	■□□□□ 0.57
PSME3-209	ENST00000589469	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	CHEK2	O96017	543 aa		18.58	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	18.58	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	DRD2	P14416	443 aa		18.58	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	SLC37A1	P57057	533 aa		18.58	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		18.58	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	PIGG	Q5H8A4	983 aa		18.58	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		18.58	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	MDGA2	Q7Z553	956 aa		18.58	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		18.58	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		18.58	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		18.58	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		18.58	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		18.58	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		18.58	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		18.58	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		18.58	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	SLC28A1	O00337	649 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	SEMA7A	O75326	666 aa		18.57	■□□□□ 0.56
PSME3-209	ENST00000589469	ERLIN1	O75477	346 aa		18.57	■□□□□ 0.56

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