RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588494.5

NEDD4L-222, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4L, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-222	ENST00000588494	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NEDD4L-222	ENST00000588494	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NEDD4L-222	ENST00000588494	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
NEDD4L-222	ENST00000588494	CABS1	Q96KC9	395 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NEDD4L-222	ENST00000588494	LURAP1	Q96LR2	239 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NEDD4L-222	ENST00000588494	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF599	Q96NL3	588 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NEDD4L-222	ENST00000588494	PANX3	Q96QZ0	392 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
NEDD4L-222	ENST00000588494	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NEDD4L-222	ENST00000588494	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
NEDD4L-222	ENST00000588494	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NEDD4L-222	ENST00000588494	KCNK13	Q9HB14	408 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NEDD4L-222	ENST00000588494	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
NEDD4L-222	ENST00000588494	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NEDD4L-222	ENST00000588494	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NEDD4L-222	ENST00000588494	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NEDD4L-222	ENST00000588494	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NEDD4L-222	ENST00000588494	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
NEDD4L-222	ENST00000588494	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		2.59	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	NEDD4	P46934	1319 aa		2.59	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		2.59	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ALS2	Q96Q42	1657 aa		2.59	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		2.59	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ALPK3	Q96L96	1907 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494		A0A0J9YWU9	116 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494		H0YIG0	161 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494		H7C423	109 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	IDH3B	O43837	385 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ECE2	O60344	883 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	GMNN	O75496	209 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRDM1	O75626	825 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	CEACAM4	O75871	244 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	GAS8	O95995	478 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	CGA	P01215	116 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	LYN	P07948	512 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	GSTA2	P09210	222 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	MMP10	P09238	476 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	MYOG	P15173	224 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	OXTR	P30559	389 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	GPR183	P32249	361 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	CLCN4	P51793	760 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM50B	P56557	158 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	HILS1	P60008	231 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	CNTN1	Q12860	1018 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	NPRL3	Q12980	569 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	CALCOCO2	Q13137	446 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	RPA4	Q13156	261 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	CEACAM7	Q14002	265 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	KCTD11	Q693B1	232 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	DOK6	Q6PKX4	331 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM64	Q6YI46	380 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ELMOD1	Q8N336	334 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC43A2	Q8N370	569 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	SMPDL3A	Q92484	453 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	KRT35	Q92764	455 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	WBP2	Q969T9	261 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC35C1	Q96A29	364 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ULK4	Q96C45	1275 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	C5orf30	Q96GV9	206 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	AGAP4	Q96P64	663 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	VGLL1	Q99990	258 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		2.58	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		2.57	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		2.57	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	LY75	O60449	1722 aa		2.57	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		2.57	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	MTOR	P42345	2549 aa		2.57	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		2.57	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	KERA	O60938	352 aa		2.57	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	AKAP3	O75969	853 aa		2.57	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	HMOX1	P09601	288 aa		2.57	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	SKIL	P12757	684 aa		2.57	□□□□□ -2
NEDD4L-222	ENST00000588494	FER	P16591	822 aa		2.57	□□□□□ -2

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