RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 BCAR3O75815 825 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 HAUS5O94927 633 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TJP3O95049 919 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 VAMP5O95183 116 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 VNN1O95497 513 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CXCL14O95715 111 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SLC16A8O95907 504 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FAM107AO95990 144 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 LCATP04180 440 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CFIP05156 583 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 HCKP08631 526 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ALPIP09923 528 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SMIM6P0DI80 62 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 THRAP10827 490 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 NR2C1P13056 603 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MTHFD2P13995 350 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CD19P15391 556 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PFKFB1P16118 471 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PSMC3P17980 439 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 LBPP18428 481 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 GNAZP19086 355 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 EN2P19622 333 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TGM2P21980 687 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 LAP3P28838 519 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 AKT2P31751 481 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 EPHX2P34913 555 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PCK1P35558 622 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 P2RY2P41231 377 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SRP9P49458 86 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CXCR3P49682 368 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CCR8P51685 355 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 DGKQP52824 942 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 DEFA6Q01524 100 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TNFRSF9Q07011 255 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SIGLEC14Q08ET2 396 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 IL18R1Q13478 541 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CSHL1Q14406 222 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 POU6F1Q14863 301 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TGFBIQ15582 683 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF174Q15697 407 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CHI3L2Q15782 390 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SLC15A2Q16348 729 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SNAPC1Q16533 368 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PCK2Q16822 640 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SPDYE7PQ495Y7 208 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF789Q5FWF6 425 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CT83Q5H943 113 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ARMCX4Q5H9R4 360 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 LCE1EQ5T753 118 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF618Q5T7W0 954 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RAET1LQ5VY80 246 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FAM91A1Q658Y4 838 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 NCR3LG1Q68D85 454 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CYB5R2Q6BCY4 276 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FRMPD2BQ6IN97 320 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM88Q6PEY1 159 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 VSTM1Q6UX27 236 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 METTL7BQ6UX53 244 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM108Q6UXF1 575 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 GDPD3Q7L5L3 318 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TDRPQ86YL5 185 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RASGRP3Q8IV61 690 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ADHFE1Q8IWW8 467 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SPATA6LQ8N4H0 392 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CYB561A3Q8NBI2 242 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 DNAAF1Q8NEP3 725 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM185AQ8NFB2 350 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 OR10A7Q8NGE5 316 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 OR52B4Q8NGK2 314 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 OR2V1Q8NHB1 315 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RAET1EQ8TD07 263 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ACTRT1Q8TDG2 376 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MRGPRDQ8TDS7 321 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 GIPC3Q8TF64 312 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CHPT1Q8WUD6 406 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ARNTL2Q8WYA1 636 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 GTF2H4Q92759 462 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 DNASE1L2Q92874 299 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SLCO2A1Q92959 643 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 P2RX5Q93086 422 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PSMG2Q969U7 264 aa2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms