RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573607.5

TOM1L1-216, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 4

Gene TOM1L1, Length 556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L1-216ENST00000573607 VPS54Q9P1Q0 977 aa4.9□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 ERVK-18Q9QC07 812 aa4.9□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 CLIP2Q9UDT6 1046 aa4.9□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa4.9□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 MEI4A8MW99 385 aa4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 POP4O95707 220 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 TRIM49P0CI25 452 aa4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 TRIM49CP0CI26 452 aa4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 CCNA2P20248 432 aa4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 ENPP2Q13822 863 aa4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 GAMTQ14353 236 aa4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 LIPKQ5VXJ0 399 aa4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 TMEM26Q6ZUK4 368 aa4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 HDDC3Q8N4P3 179 aa4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 BANPQ8N9N5 519 aa4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 OR1K1Q8NGR3 316 aa4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 SAMD8Q96LT4 415 aa4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 FAM111AQ96PZ2 611 aa4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 DCTN5Q9BTE1 182 aa4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 KRT23Q9C075 422 aa4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 C1orf21Q9H246 121 aa4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 VPS33BQ9H267 617 aa4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 NT5DC2Q9H857 520 aa4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 SLC6A5Q9Y345 797 aa4.89□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 PDHXO00330 501 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 FCER2P06734 321 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 CYP11B1P15538 503 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 PTPN4P29074 926 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 ETV5P41161 510 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 NPY2RP49146 381 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 ZNF131P52739 623 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 SSTP61278 116 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 FCN2Q15485 313 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 ZNF528Q3MIS6 628 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 ZNF343Q6P1L6 599 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 RPAINQ86UA6 219 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 KDM8Q8N371 416 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 LRRC17Q8N6Y2 441 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 HIST1H2ACQ93077 130 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 TMEM45BQ96B21 275 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 ZNF597Q96LX8 424 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 ACCSQ96QU6 501 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 NLNQ9BYT8 704 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 STRADBQ9C0K7 418 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 EGLN1Q9GZT9 426 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 SOHLH2Q9NX45 425 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 THYN1Q9P016 225 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 IL20RAQ9UHF4 553 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 PLA2G4CQ9UP65 541 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 ENTPD4Q9Y227 616 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 ZMYM6O95789 1325 aa4.88□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 A0A0J9YWU9 116 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 C19orf81C9J6K1 198 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 E9PQ18 207 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 TSPAN2O60636 221 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 GAS8-AS1O95177 125 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 IGHG3P01860 377 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 OR9G9P0C7N8 305 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 CAPGP40121 348 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 CAMLGP49069 296 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 SRPXP78539 464 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 AGKQ53H12 422 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 UNC50Q53HI1 259 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 MUC21Q5SSG8 566 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 C1orf189Q5VU69 101 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 ICA1LQ8NDH6 482 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 OR1B1Q8NGR6 318 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 PHYHIPQ92561 330 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 CAPNS2Q96L46 248 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 CBWD1Q9BRT8 395 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 CHCHD5Q9BSY4 110 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 MOB1AQ9H8S9 216 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 HOMER3Q9NSC5 361 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 TAS2R16Q9NYV7 291 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 CTSZQ9UBR2 303 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 LHX3Q9UBR4 397 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 IKZF3Q9UKT9 509 aa4.87□□□□□ -1.63
TOM1L1-216ENST00000573607 FBXO7Q9Y3I1 522 aa4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms