RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567817.5

CAPN3-217, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 711 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-217ENST00000567817 DAG1Q14118 895 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 DMC1Q14565 340 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 PTPRCAPQ14761 206 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 MAPKAPK3Q16644 382 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 IMPG1Q17R60 797 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 COL28A1Q2UY09 1125 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 MYLK3Q32MK0 819 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 PLEKHG6Q3KR16 790 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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CAPN3-217ENST00000567817 ATG9BQ674R7 924 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 GLYATQ6IB77 296 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 HMBOX1Q6NT76 420 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 ERICH5Q6P6B1 374 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 Q6ZSR9 355 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 TPGS1Q6ZTW0 290 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 LPCAT2Q7L5N7 544 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa5.05□□□□□ -1.6
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CAPN3-217ENST00000567817 SERPINA9Q86WD7 417 aa5.05□□□□□ -1.6
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CAPN3-217ENST00000567817 METTL25Q8N6Q8 603 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 PAF1Q8N7H5 531 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 OR2T12Q8NG77 320 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 OR4F6Q8NGB9 312 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 OR2AP1Q8NGE2 309 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 DNAJB14Q8TBM8 379 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 ITCHQ96J02 903 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 MPP4Q96JB8 637 aa5.05□□□□□ -1.6
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CAPN3-217ENST00000567817 KCNA7Q96RP8 456 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 COPS8Q99627 209 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 CGREF1Q99674 301 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 TIMP4Q99727 224 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 SLC29A1Q99808 456 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 EGFL8Q99944 293 aa5.05□□□□□ -1.6
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CAPN3-217ENST00000567817 SLC39A3Q9BRY0 314 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 DPY30Q9C005 99 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 LMAN1LQ9HAT1 526 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 LRTM1Q9HBL6 345 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 ABCB8Q9NUT2 735 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 OLAHQ9NV23 265 aa5.05□□□□□ -1.6
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CAPN3-217ENST00000567817 C1orf109Q9NX04 203 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 USE1Q9NZ43 259 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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CAPN3-217ENST00000567817 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 PPIL1Q9Y3C6 166 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 ORC6Q9Y5N6 252 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 OR51B4Q9Y5P0 310 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
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CAPN3-217ENST00000567817 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 A0A096LPI6 279 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 ELOVL7A1L3X0 281 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 SAC3D1A6NKF1 404 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 C4orf47A7E2U8 309 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 G3V2T6 193 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 J3QKU1 62 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 PPP6CO00743 305 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 SOCS2O14508 198 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 OR7A17O14581 309 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 EI24O14681 340 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 ANKRD28O15084 1053 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 ACOX3O15254 700 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 OR1I1O60431 355 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 DPM1O60762 260 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 TBL1XO60907 577 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 PROP1O75360 226 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 GJB3O75712 270 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 STK16O75716 305 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 UBXN7O94888 489 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CAPN3-217ENST00000567817 CLDN9O95484 217 aa5.04□□□□□ -1.6
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