RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559061.5

SNX1-204, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 5

Gene SNX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-204ENST00000559061 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 C9orf40Q8IXQ3 194 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 LIX1Q8N485 282 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 OR4K14Q8NGD5 310 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 OR1N1Q8NGS0 311 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 CTHRC1Q96CG8 243 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 KLHL29Q96CT2 875 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 C7orf26Q96N11 449 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 ANKRA2Q9H9E1 313 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
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SNX1-204ENST00000559061 MAT2BQ9NZL9 334 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 EHD3Q9NZN3 535 aa10.64□□□□□ -0.71
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SNX1-204ENST00000559061 DTX4Q9Y2E6 619 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 MYO1GB0I1T2 1018 aa10.63□□□□□ -0.71
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SNX1-204ENST00000559061 ZNF628Q5EBL2 1059 aa10.63□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 CRB2Q5IJ48 1285 aa10.63□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 FHL5Q5TD97 284 aa10.63□□□□□ -0.71
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SNX1-204ENST00000559061 ATG16L1Q676U5 607 aa10.63□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 LYPD8Q6UX82 237 aa10.63□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 LINC00696Q6ZRV3 163 aa10.63□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 IKBIPQ70UQ0 350 aa10.63□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 TICAM1Q8IUC6 712 aa10.63□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 RIMKLAQ8IXN7 391 aa10.63□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 BEST3Q8N1M1 668 aa10.63□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa10.63□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 ZNF615Q8N8J6 731 aa10.63□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 ZNF441Q8N8Z8 693 aa10.63□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 MORN4Q8NDC4 146 aa10.63□□□□□ -0.71
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SNX1-204ENST00000559061 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
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SNX1-204ENST00000559061 OR52B2Q96RD2 323 aa10.63□□□□□ -0.71
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SNX1-204ENST00000559061 OR8D2Q9GZM6 311 aa10.63□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 KCNK13Q9HB14 408 aa10.63□□□□□ -0.71
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SNX1-204ENST00000559061 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa10.62□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 GOLGA8OA6NCC3 632 aa10.62□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 GOLGA8NF8WBI6 632 aa10.62□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 HDAC3O15379 428 aa10.62□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 ATP8B1O43520 1251 aa10.62□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 AKAP10O43572 662 aa10.62□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 TBX19O60806 448 aa10.62□□□□□ -0.71
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SNX1-204ENST00000559061 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 WDPCPO95876 746 aa10.62□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 PORP16435 677 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
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SNX1-204ENST00000559061 GSTM5P46439 218 aa10.62□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 SLC37A1P57057 533 aa10.62□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 C21orf58P58505 322 aa10.62□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 EMX2Q04743 252 aa10.62□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 NFATC3Q12968 1075 aa10.62□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa10.62□□□□□ -0.71
SNX1-204ENST00000559061 ACER2Q5QJU3 275 aa10.62□□□□□ -0.71
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