RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CS-233	ENST00000552688	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CS-233	ENST00000552688	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PINLYP	A6NC86	204 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SYCE1L	A8MT33	242 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	FAM166B	A8MTA8	275 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	AHRR	A9YTQ3	701 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PPP6C	O00743	305 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	DVL2	O14641	736 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	B3GALT2	O43825	422 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	DLX3	O60479	287 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ATP6AP2	O75787	350 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	OR6B1	O95007	311 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PROC	P04070	461 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	RBP1	P09455	135 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CD22	P20273	847 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	UQCRC1	P31930	480 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ADH7	P40394	386 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SOX3	P41225	446 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	MAGEA5	P43359	124 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	HNMT	P50135	292 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ASCL1	P50553	236 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	RAB38	P57729	211 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	BTN3A2	P78410	334 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CDKL1	Q00532	357 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	REEP5	Q00765	189 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	FOXO1	Q12778	655 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SLC13A2	Q13183	592 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CHIT1	Q13231	466 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	GTF2H2	Q13888	395 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SERTAD2	Q14140	314 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	KEAP1	Q14145	624 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	DOC2A	Q14183	400 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	MPEG1	Q2M385	716 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SGO1	Q5FBB7	561 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CA13	Q8N1Q1	262 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	MGARP	Q8TDB4	240 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ANKRD7	Q92527	254 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TMEM237	Q96Q45	408 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	RHBG	Q9H310	441 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	EXO5	Q9H790	373 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	GTF3C1	Q12789	2109 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	LRIT2	A6NDA9	550 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	C4orf51	C9J302	202 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688		G3V2L1	256 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688		K7EPI3	171 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	WWP2	O00308	870 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	OR7A17	O14581	309 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ARHGEF9	O43307	516 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	PLIN3	O60664	434 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	CTNS	O60931	367 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	SUPT7L	O94864	414 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	ATE1	O95260	518 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	EPPIN	O95925	133 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CS-233	ENST00000552688	IFNA16	P05015	189 aa		6.32	□□□□□ -1.4

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